49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4176 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  56.29 
 
 		 216 aa  197  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  54.76 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  50 
 
 		 202 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  48.19 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  47.19 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  47.19 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  47.78 
 
 		 197 aa  168  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  44.32 
 
 		 214 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  47.27 
 
 		 194 aa  167  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  44.83 
 
 		 214 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  45.51 
 
 		 211 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  43.02 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  40.91 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  43.02 
 
 		 186 aa  157  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  46.86 
 
 		 181 aa  157  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  43.02 
 
 		 238 aa  157  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0306  hypothetical protein  43.21 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  36.87 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  38.79 
 
 		 204 aa  137  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  32.61 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  25.13 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0477  hypothetical protein  24.57 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.935233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  23.64 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.14 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  24.56 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  21.93 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  26.79 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  21.66 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  21.66 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  26.81 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.7 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  25.56 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  26.81 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  24.85 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.86 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.86 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  24.86 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  25 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  24.83 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  25.45 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  21.89 
 
 		 270 aa  45.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.92 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.69 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  22.84 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  19.87 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2112  hypothetical protein  21.74 
 
 		 214 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.769057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  21.6 
 
 		 225 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>