18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2112 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2112  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  430  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.769057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.24 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1085  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.19 
 
 		 208 aa  121  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.84 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03850  hypothetical protein  30.77 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.75 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  24.32 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0184  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  20.92 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0912  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.53 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2190  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.72 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.806503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3596  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.02 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.04 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.730307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  23.22 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  21.76 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.78 
 
 		 200 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  22.84 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  22.84 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.37 
 
 		 201 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>