66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2658 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0912  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.37 
 
 		 221 aa  91.3  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.78 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.6 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2112  hypothetical protein  23.36 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.769057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03850  hypothetical protein  20.11 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0184  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.31 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1085  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.15 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.84 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.89 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  28.19 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.48 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  26.6 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  25 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  25.13 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.84 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1574  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.38 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.057142  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  23.68 
 
 		 172 aa  48.1  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.81 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0848  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.62 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  29.67 
 
 		 257 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0836  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.62 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.39 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4003  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.84 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0440839  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3608  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.84 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1830  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.84 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.09 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0088  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.78 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0095  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.78 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  24.37 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2422  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.47 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0106  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.78 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29 
 
 		 339 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1599  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.53 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.17 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.57 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.9 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4079  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.15 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.05 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.6 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3440  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.77 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3585  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.88 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1039  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.09 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236245  normal  0.725621 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0976  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.23 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.84 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0937  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.23 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.723645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3407  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.65 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.85 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  21.39 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0497  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.23 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  26.32 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  22.6 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  26.44 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1549  outer-membrane lipoprotein carrier protein  20.57 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.58 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  24.49 
 
 		 186 aa  42  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  34.67 
 
 		 203 aa  42  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.59 
 
 		 212 aa  42  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72131  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.16 
 
 		 238 aa  42  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.3 
 
 		 221 aa  42  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1394  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.12 
 
 		 208 aa  41.6  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3381  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.59 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.23519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.2 
 
 		 268 aa  41.6  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.81 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.455724  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.21 
 
 		 229 aa  41.2  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  24.34 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>