55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0445 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 268 aa  537  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  76.54 
 
 		 227 aa  295  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50.46 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  56.44 
 
 		 332 aa  204  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  49.1 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  54.82 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  53.51 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  53.51 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  52.35 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  51.53 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  47.37 
 
 		 280 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  49.69 
 
 		 315 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.62 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  47.37 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.33 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  44.6 
 
 		 313 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  40.85 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.26 
 
 		 216 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.27 
 
 		 243 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.02 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  41.83 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  41.18 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.1 
 
 		 230 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.36 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  38.36 
 
 		 210 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.55 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.84 
 
 		 212 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.58 
 
 		 221 aa  95.5  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  31.14 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.14 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.74 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.66 
 
 		 206 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  31.91 
 
 		 203 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.26 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.76 
 
 		 198 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.48 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  31.52 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.45 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.09 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.46 
 
 		 233 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  32.61 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.94 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.26 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.75 
 
 		 223 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.64 
 
 		 238 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1394  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.32 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.14 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  24.55 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.16 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.16 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.72 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2340  outer-membrane lipoprotein carrier protein  33.33 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>