83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5008 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 
212 aa  417  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.57 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.57 
 
 
339 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  40.51 
 
 
234 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000236321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.67 
 
 
243 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  33.53 
 
 
257 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.91 
 
 
312 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.11 
 
 
313 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 
221 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.84 
 
 
198 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.11 
 
 
332 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.67 
 
 
222 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.71 
 
 
212 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.67 
 
 
222 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35 
 
 
268 aa  101  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  36.54 
 
 
220 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  34.78 
 
 
212 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.78 
 
 
212 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.53 
 
 
317 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.51 
 
 
221 aa  98.6  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.53 
 
 
315 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.67 
 
 
280 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.66 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.33 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.48 
 
 
198 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.66 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.43 
 
 
302 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.55 
 
 
314 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.51 
 
 
315 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.51 
 
 
315 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  31.37 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  35.06 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  34.48 
 
 
230 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.5 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.77 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.41 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.22 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.51 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  32.72 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.68 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.65 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.03 
 
 
208 aa  62  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  25.41 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.64 
 
 
236 aa  58.5  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.74 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  37.98 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.34 
 
 
210 aa  52  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  22.05 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  32.2 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.2 
 
 
230 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.04 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.64 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.12 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.78 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.84 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2555  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.78 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2151  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.78 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100483  normal  0.437177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.52 
 
 
210 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1826  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.84 
 
 
219 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119174  hitchhiker  0.00000680848 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3348  outer membrane lipoprotein carrier protein  33.12 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00496768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3178  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.47 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308735  normal  0.0497193 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  22.11 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.57 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  32.47 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.03 
 
 
233 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2340  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.22 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0636  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.6 
 
 
231 aa  45.1  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3407  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.59 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1039  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.65 
 
 
244 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236245  normal  0.725621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3440  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.65 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  26.16 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1121  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.29 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.310503  normal  0.176319 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  26.95 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  26.95 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2482  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.46 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000211708  hitchhiker  0.000000303985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3381  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.46 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.23519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.46 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72131  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1518  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.7 
 
 
273 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0686  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.04 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.51 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2599  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.73 
 
 
212 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.98 
 
 
205 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.04 
 
 
214 aa  41.6  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>