39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1763 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 204 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1085  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  47.26 
 
 		 208 aa  175  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03850  hypothetical protein  40.1 
 
 		 209 aa  158  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2112  hypothetical protein  31.84 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.769057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.02 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  23.65 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  23.84 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.7 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  24.1 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.89 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.49 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  23.49 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  24.1 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.72 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.5 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0184  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.35 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0799  hypothetical protein  26.11 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.817387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.1 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  24.05 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.52 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0912  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.09 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0942  putative transmembrane protein  26.11 
 
 		 238 aa  45.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.98 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  24.26 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1495  hypothetical protein  23.3 
 
 		 188 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.635359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  20.8 
 
 		 228 aa  44.7  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  20.18 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2190  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.41 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.806503  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3178  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.22 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308735  normal  0.0497193 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  25.56 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3348  outer membrane lipoprotein carrier protein  27.27 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00496768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  25.2 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  23.12 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.15 
 
 		 248 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  21.99 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3596  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.75 
 
 		 202 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  24.63 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  24.63 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  20.15 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>