25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03850 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03850  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1085  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  50.73 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1763  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.1 
 
 		 204 aa  158  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2112  hypothetical protein  30.77 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.769057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.92 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.46 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0912  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.49 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  20.11 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  25.58 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.85 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  24.7 
 
 		 270 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  24.43 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0918  putative lipoprotein  18.75 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  21.57 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.98 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.32 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.12 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  24.56 
 
 		 276 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  19.88 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  22.61 
 
 		 271 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  23.81 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  21.74 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  21.21 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  21.13 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.7 
 
 		 208 aa  42  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>