55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2754 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  30.29 
 
 
187 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  32.12 
 
 
228 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  30.77 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  35.22 
 
 
210 aa  94.4  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  29.7 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  26.94 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  33.91 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.73 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  32.78 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  29.95 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  29.95 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  28.48 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  32.34 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  27.65 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  31.33 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.05 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.06 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  33.15 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0974  hypothetical protein  25.88 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  27.32 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.22 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  29.35 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.03 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.43 
 
 
257 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  23.94 
 
 
271 aa  58.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2673  hypothetical protein  28.32 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  27.98 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  27.22 
 
 
267 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  26.54 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  26.04 
 
 
256 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.63 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0283  flagellum-specific ATP synthase  21.39 
 
 
172 aa  53.1  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  26 
 
 
280 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2066  fatty acyl-CoA synthetase  29.5 
 
 
173 aa  52  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  26.44 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  26.44 
 
 
271 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1321  hypothetical protein  28.08 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  24.75 
 
 
272 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1989  putative secreted protein  27.52 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.565001  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  24.75 
 
 
272 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4176  hypothetical protein  24.2 
 
 
189 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1986  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.4 
 
 
210 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.46 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  25.62 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0067  hypothetical protein  25.97 
 
 
199 aa  48.5  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2749  hypothetical protein  28.48 
 
 
194 aa  48.5  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3930  putative transmembrane protein  26.57 
 
 
202 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.47 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  26.83 
 
 
211 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  29.41 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03732  fatty acyl CoA synthetase  26.22 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  26.38 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3300  putative transmembrane protein  22.49 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293051  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  27.17 
 
 
214 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>