260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0595 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  57.72 
 
 		 830 aa  926    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  78.26 
 
 		 805 aa  1285    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  78.14 
 
 		 805 aa  1285    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  99 
 
 		 805 aa  1619    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  100 
 
 		 806 aa  1647    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  30.06 
 
 		 790 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  30.43 
 
 		 791 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  29 
 
 		 799 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  29.48 
 
 		 797 aa  364  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  31.13 
 
 		 792 aa  363  6e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  28.24 
 
 		 796 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  28.55 
 
 		 808 aa  322  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  25.75 
 
 		 784 aa  244  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  25.61 
 
 		 769 aa  243  9e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  24.69 
 
 		 767 aa  241  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  24.65 
 
 		 768 aa  240  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  25.32 
 
 		 795 aa  237  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  24.93 
 
 		 768 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  23.86 
 
 		 772 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  24.38 
 
 		 771 aa  235  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  24.27 
 
 		 771 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  24.52 
 
 		 772 aa  233  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  24.72 
 
 		 771 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  24.72 
 
 		 771 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  25.69 
 
 		 799 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  24.94 
 
 		 771 aa  232  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  24.88 
 
 		 799 aa  232  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  25.81 
 
 		 799 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  24.75 
 
 		 771 aa  231  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  24.69 
 
 		 771 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  25.35 
 
 		 784 aa  230  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  24.69 
 
 		 771 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  25.81 
 
 		 799 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  25.34 
 
 		 790 aa  228  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  25.4 
 
 		 793 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  24.72 
 
 		 796 aa  226  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  22.81 
 
 		 767 aa  225  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  24.56 
 
 		 771 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  24.11 
 
 		 770 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  24.78 
 
 		 821 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  24.36 
 
 		 821 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  25.26 
 
 		 796 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  24.97 
 
 		 834 aa  218  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  24.18 
 
 		 794 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  25.57 
 
 		 820 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  24.6 
 
 		 816 aa  211  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  24.5 
 
 		 1051 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  25.25 
 
 		 804 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  23.13 
 
 		 787 aa  209  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  25.39 
 
 		 797 aa  206  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  25.06 
 
 		 786 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  24.72 
 
 		 799 aa  203  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  25.75 
 
 		 786 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  25.69 
 
 		 786 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  25.69 
 
 		 786 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  25.22 
 
 		 786 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  22.95 
 
 		 787 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  24.66 
 
 		 786 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  24.63 
 
 		 831 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  25.79 
 
 		 813 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  24.24 
 
 		 826 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  24.64 
 
 		 810 aa  195  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  24.41 
 
 		 813 aa  194  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  23.55 
 
 		 771 aa  194  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  24.72 
 
 		 804 aa  194  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  25.79 
 
 		 813 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  24.42 
 
 		 799 aa  191  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  25.77 
 
 		 786 aa  190  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  25.62 
 
 		 786 aa  187  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  25.62 
 
 		 786 aa  187  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  25.1 
 
 		 794 aa  187  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  23.82 
 
 		 808 aa  186  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  23.49 
 
 		 827 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  25.65 
 
 		 809 aa  185  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  24.04 
 
 		 783 aa  182  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  24.87 
 
 		 808 aa  172  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.22 
 
 		 764 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.62 
 
 		 831 aa  121  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  21.02 
 
 		 778 aa  108  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.22 
 
 		 801 aa  107  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  20.6 
 
 		 788 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.6 
 
 		 808 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.74 
 
 		 807 aa  97.8  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.49 
 
 		 773 aa  90.9  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  21.59 
 
 		 881 aa  87  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.12 
 
 		 806 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  19.66 
 
 		 767 aa  85.1  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.75 
 
 		 837 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  19.71 
 
 		 905 aa  82  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  20.86 
 
 		 815 aa  82  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  20.85 
 
 		 789 aa  79.3  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1083 aa  79.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.7 
 
 		 804 aa  79.3  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  24.12 
 
 		 877 aa  79.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  19.26 
 
 		 779 aa  78.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  22.51 
 
 		 869 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  34.64 
 
 		 898 aa  76.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  21.47 
 
 		 792 aa  75.5  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  22.01 
 
 		 869 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  22.19 
 
 		 779 aa  74.3  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>