275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0133 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  63.05 
 
 		 799 aa  995    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  51.34 
 
 		 813 aa  736    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  50.58 
 
 		 799 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  68.03 
 
 		 826 aa  1028    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  48.31 
 
 		 787 aa  720    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  50.9 
 
 		 796 aa  773    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  51.65 
 
 		 796 aa  768    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  50.38 
 
 		 790 aa  739    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  60.03 
 
 		 821 aa  889    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  50.19 
 
 		 799 aa  748    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  50.26 
 
 		 794 aa  757    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  57 
 
 		 831 aa  896    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  51.56 
 
 		 813 aa  750    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  58.32 
 
 		 827 aa  886    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  60.55 
 
 		 808 aa  907    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  51.98 
 
 		 809 aa  735    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  42.67 
 
 		 772 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  100 
 
 		 808 aa  1632    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  55.94 
 
 		 834 aa  865    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  50.64 
 
 		 784 aa  752    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  49.87 
 
 		 793 aa  734    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  59.39 
 
 		 821 aa  886    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  66.5 
 
 		 813 aa  1034    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  50.58 
 
 		 799 aa  753    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  50.32 
 
 		 799 aa  751    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  43.91 
 
 		 768 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  50.19 
 
 		 795 aa  764    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  42.06 
 
 		 770 aa  632  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  42.67 
 
 		 769 aa  634  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  42.75 
 
 		 771 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  42.75 
 
 		 771 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  42.8 
 
 		 767 aa  628  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  42.41 
 
 		 771 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  42.41 
 
 		 771 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  42.41 
 
 		 771 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  42.28 
 
 		 771 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  42.49 
 
 		 771 aa  625  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  41.25 
 
 		 771 aa  621  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  41.8 
 
 		 767 aa  620  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  42.41 
 
 		 772 aa  615  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  42.21 
 
 		 771 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  41.43 
 
 		 768 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  41.16 
 
 		 784 aa  593  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  41.25 
 
 		 771 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  41.34 
 
 		 820 aa  582  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  40.81 
 
 		 787 aa  549  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  40.31 
 
 		 794 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  41.57 
 
 		 810 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  38.39 
 
 		 816 aa  532  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  39.06 
 
 		 783 aa  523  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  39.39 
 
 		 786 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  38.16 
 
 		 786 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  39.19 
 
 		 797 aa  488  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  37.18 
 
 		 786 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  37.87 
 
 		 786 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  37.18 
 
 		 786 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  37.74 
 
 		 786 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  37.74 
 
 		 786 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  37.52 
 
 		 786 aa  478  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  37.08 
 
 		 786 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  38.57 
 
 		 804 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  38.25 
 
 		 804 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  37.52 
 
 		 799 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  27.86 
 
 		 791 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  26.5 
 
 		 797 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  27.02 
 
 		 790 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  26.76 
 
 		 808 aa  255  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  26.84 
 
 		 792 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  26.97 
 
 		 799 aa  238  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  26.12 
 
 		 796 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  24.06 
 
 		 830 aa  187  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  24.33 
 
 		 805 aa  179  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  24.33 
 
 		 805 aa  179  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  24.58 
 
 		 805 aa  177  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  24.62 
 
 		 806 aa  177  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.87 
 
 		 788 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21 
 
 		 773 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.13 
 
 		 831 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  23.37 
 
 		 804 aa  109  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.76 
 
 		 808 aa  110  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  18.66 
 
 		 806 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  20.58 
 
 		 803 aa  100  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.05 
 
 		 1051 aa  95.5  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  21.8 
 
 		 778 aa  94.7  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  19.18 
 
 		 727 aa  92.8  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24.69 
 
 		 905 aa  90.9  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  22.77 
 
 		 800 aa  74.7  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  21.79 
 
 		 752 aa  73.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  26 
 
 		 815 aa  70.5  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  21.77 
 
 		 861 aa  70.1  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.65 
 
 		 807 aa  68.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  22.59 
 
 		 807 aa  66.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.3 
 
 		 764 aa  64.7  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  19.95 
 
 		 779 aa  64.3  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.18 
 
 		 747 aa  63.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  19.83 
 
 		 385 aa  62  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.91 
 
 		 1291 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  24.69 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20.63 
 
 		 869 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.57 
 
 		 755 aa  60.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>