172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6867 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  48.59 
 
 		 799 aa  733    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  48.07 
 
 		 799 aa  729    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  57 
 
 		 826 aa  851    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  54.06 
 
 		 813 aa  798    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  45.33 
 
 		 787 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  55.19 
 
 		 799 aa  846    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  47.94 
 
 		 796 aa  726    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  48.84 
 
 		 796 aa  729    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  46.77 
 
 		 794 aa  729    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  63.35 
 
 		 831 aa  1000    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  54.31 
 
 		 809 aa  768    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  100 
 
 		 827 aa  1677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  58.32 
 
 		 808 aa  856    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  60.7 
 
 		 834 aa  976    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  60.61 
 
 		 821 aa  968    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  46.07 
 
 		 793 aa  701    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  53.37 
 
 		 813 aa  790    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  62.66 
 
 		 808 aa  921    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  46.19 
 
 		 795 aa  707    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  48.48 
 
 		 799 aa  736    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  46.32 
 
 		 790 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  57.48 
 
 		 813 aa  862    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  48.04 
 
 		 784 aa  716    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  60.98 
 
 		 821 aa  951    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  48.46 
 
 		 799 aa  730    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  40.54 
 
 		 771 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  40.54 
 
 		 771 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  41.61 
 
 		 768 aa  602  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  40.67 
 
 		 771 aa  598  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  40.28 
 
 		 771 aa  595  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  40.08 
 
 		 772 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  40.67 
 
 		 771 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  40.67 
 
 		 771 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  40.67 
 
 		 771 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  39.82 
 
 		 770 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  40.78 
 
 		 769 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  39.71 
 
 		 768 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  40.54 
 
 		 771 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  40.42 
 
 		 767 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  40.1 
 
 		 771 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  39.53 
 
 		 767 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  40.73 
 
 		 772 aa  572  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  39.39 
 
 		 784 aa  557  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  38.46 
 
 		 771 aa  537  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  37.72 
 
 		 820 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  36.94 
 
 		 816 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  39.44 
 
 		 810 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  37.42 
 
 		 787 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  35.57 
 
 		 786 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  35.73 
 
 		 786 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  35.44 
 
 		 786 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  35.36 
 
 		 786 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  35.36 
 
 		 786 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  36.99 
 
 		 804 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  35.5 
 
 		 804 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  35.32 
 
 		 786 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  35.19 
 
 		 786 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  35.19 
 
 		 786 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  34.89 
 
 		 786 aa  452  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  34.73 
 
 		 794 aa  452  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  35.01 
 
 		 797 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  34.26 
 
 		 783 aa  426  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  33.12 
 
 		 799 aa  422  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  27.25 
 
 		 808 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  25.52 
 
 		 791 aa  248  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  25.97 
 
 		 792 aa  243  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  25.71 
 
 		 790 aa  241  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  25.42 
 
 		 797 aa  241  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  26.98 
 
 		 799 aa  226  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  26.35 
 
 		 796 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  24.63 
 
 		 830 aa  204  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  24.3 
 
 		 805 aa  195  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  24.3 
 
 		 805 aa  195  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  23.48 
 
 		 805 aa  182  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  23.48 
 
 		 806 aa  182  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.24 
 
 		 764 aa  124  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.17 
 
 		 1051 aa  101  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.36 
 
 		 788 aa  93.2  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  23.17 
 
 		 778 aa  92.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.31 
 
 		 808 aa  87.8  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.06 
 
 		 755 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  18.87 
 
 		 773 aa  85.9  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  19.31 
 
 		 806 aa  85.1  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.59 
 
 		 800 aa  75.5  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.04 
 
 		 807 aa  75.1  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.51 
 
 		 803 aa  73.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.81 
 
 		 804 aa  72.4  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  19.5 
 
 		 727 aa  69.3  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  22.05 
 
 		 905 aa  67.8  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.78 
 
 		 831 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  24.62 
 
 		 898 aa  65.5  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  21.59 
 
 		 811 aa  64.3  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  25.79 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  21.75 
 
 		 869 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  24.1 
 
 		 860 aa  60.1  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  22.94 
 
 		 756 aa  59.3  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.04 
 
 		 861 aa  59.3  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  18.56 
 
 		 767 aa  58.5  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  21.75 
 
 		 869 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  28.06 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>