More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2971 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  71.86 
 
 		 804 aa  1153    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  70.45 
 
 		 786 aa  1115    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  100 
 
 		 797 aa  1626    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  69.94 
 
 		 786 aa  1153    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  45.49 
 
 		 787 aa  638    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  70.97 
 
 		 804 aa  1129    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  72.36 
 
 		 799 aa  1145    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  70.96 
 
 		 786 aa  1140    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  69.81 
 
 		 786 aa  1124    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  69.81 
 
 		 786 aa  1124    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  71.59 
 
 		 786 aa  1193    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  68.92 
 
 		 786 aa  1139    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  69.94 
 
 		 786 aa  1153    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  53.37 
 
 		 783 aa  775    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  47.69 
 
 		 794 aa  684    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  69.94 
 
 		 786 aa  1153    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  42.49 
 
 		 768 aa  593  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  41.94 
 
 		 784 aa  592  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  41.98 
 
 		 771 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  43.01 
 
 		 767 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  42.45 
 
 		 771 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  42.45 
 
 		 771 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  42.45 
 
 		 771 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  42.38 
 
 		 772 aa  582  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  40.99 
 
 		 768 aa  578  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  41.73 
 
 		 770 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  41.58 
 
 		 767 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  40.9 
 
 		 772 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  42.65 
 
 		 771 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  41.85 
 
 		 771 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  41.85 
 
 		 771 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  42.39 
 
 		 771 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  41.72 
 
 		 771 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  41.74 
 
 		 771 aa  572  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  40.47 
 
 		 769 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  40.05 
 
 		 820 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  36.68 
 
 		 799 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  36.88 
 
 		 799 aa  506  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  36.45 
 
 		 794 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  38.6 
 
 		 795 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  36.5 
 
 		 799 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  36.5 
 
 		 799 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  37.29 
 
 		 790 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  35.82 
 
 		 796 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  36.46 
 
 		 796 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  37.22 
 
 		 793 aa  499  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  38.08 
 
 		 784 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  37.69 
 
 		 816 aa  488  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  36.33 
 
 		 799 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  38.48 
 
 		 813 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  36.07 
 
 		 787 aa  469  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  40.27 
 
 		 810 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  39.19 
 
 		 808 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  36.73 
 
 		 821 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  36.33 
 
 		 821 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  38.35 
 
 		 808 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  36.7 
 
 		 826 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  38.17 
 
 		 813 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  38.83 
 
 		 809 aa  459  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  37.9 
 
 		 813 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  36.88 
 
 		 831 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  35.01 
 
 		 827 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  34.36 
 
 		 834 aa  422  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  28.5 
 
 		 797 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  29.51 
 
 		 799 aa  266  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  25.26 
 
 		 790 aa  251  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  26.48 
 
 		 796 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  26.81 
 
 		 808 aa  244  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  25.85 
 
 		 791 aa  242  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  26.31 
 
 		 792 aa  223  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  25.99 
 
 		 830 aa  214  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  25.42 
 
 		 806 aa  201  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  25.42 
 
 		 805 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  26.26 
 
 		 805 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  26.26 
 
 		 805 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.5 
 
 		 764 aa  124  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  23.62 
 
 		 755 aa  108  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  22.2 
 
 		 869 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.47 
 
 		 773 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  19.52 
 
 		 831 aa  92.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  22.06 
 
 		 869 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.15 
 
 		 807 aa  88.6  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.35 
 
 		 1051 aa  85.5  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  18.7 
 
 		 767 aa  83.6  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.48 
 
 		 806 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  22.93 
 
 		 752 aa  82  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  20.97 
 
 		 788 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.81 
 
 		 803 aa  82  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  25.9 
 
 		 388 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  20.9 
 
 		 792 aa  74.7  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  23.94 
 
 		 385 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24.81 
 
 		 905 aa  72.8  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  21.84 
 
 		 804 aa  73.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  21.86 
 
 		 765 aa  71.6  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  22.43 
 
 		 752 aa  70.1  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  22.78 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  19.84 
 
 		 864 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  22.48 
 
 		 385 aa  67  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  26.45 
 
 		 788 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.85 
 
 		 746 aa  67  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>