295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1591 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  46.21 
 
 		 799 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  50.59 
 
 		 784 aa  769    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  79.22 
 
 		 772 aa  1261    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  65.31 
 
 		 772 aa  1031    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  44.85 
 
 		 787 aa  645    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  83.18 
 
 		 771 aa  1276    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  83.05 
 
 		 771 aa  1288    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  45.87 
 
 		 796 aa  688    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  46.72 
 
 		 799 aa  703    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  81.41 
 
 		 767 aa  1255    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  46.33 
 
 		 796 aa  687    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  81.43 
 
 		 767 aa  1263    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  48.82 
 
 		 784 aa  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  44.27 
 
 		 787 aa  655    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  83.05 
 
 		 771 aa  1272    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  45.14 
 
 		 794 aa  677    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  82.75 
 
 		 771 aa  1272    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  83.31 
 
 		 771 aa  1275    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  46.19 
 
 		 799 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  83.18 
 
 		 771 aa  1276    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  81.53 
 
 		 769 aa  1258    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  46.19 
 
 		 799 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  64.59 
 
 		 771 aa  998    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  83.4 
 
 		 771 aa  1299    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  83.4 
 
 		 771 aa  1299    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  82.68 
 
 		 768 aa  1276    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  80.78 
 
 		 770 aa  1264    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  46.33 
 
 		 793 aa  685    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  44.68 
 
 		 799 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  83.01 
 
 		 771 aa  1296    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  46.33 
 
 		 790 aa  685    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  100 
 
 		 768 aa  1551    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  43.46 
 
 		 795 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  43.58 
 
 		 808 aa  633  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  43.15 
 
 		 826 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  43.84 
 
 		 820 aa  630  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  44.27 
 
 		 821 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  43.68 
 
 		 821 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  42.69 
 
 		 794 aa  615  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  42.25 
 
 		 783 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  44.73 
 
 		 813 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  42.73 
 
 		 831 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  43.91 
 
 		 808 aa  611  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  41.61 
 
 		 816 aa  609  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  42.65 
 
 		 834 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  43.1 
 
 		 810 aa  590  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  41.58 
 
 		 827 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  40.15 
 
 		 786 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  41.18 
 
 		 799 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  41.18 
 
 		 786 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  42.49 
 
 		 797 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  40.66 
 
 		 786 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  40.66 
 
 		 786 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  40.36 
 
 		 804 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  41.68 
 
 		 786 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  41.18 
 
 		 786 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  39.9 
 
 		 786 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  39.77 
 
 		 786 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  39.77 
 
 		 786 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  39.92 
 
 		 804 aa  552  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  40.58 
 
 		 813 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  41.49 
 
 		 813 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  40.84 
 
 		 809 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  28.54 
 
 		 808 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  27.32 
 
 		 797 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  28.85 
 
 		 799 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  27.76 
 
 		 791 aa  290  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  25.16 
 
 		 790 aa  281  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  27.87 
 
 		 796 aa  266  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  25.44 
 
 		 792 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  25.25 
 
 		 830 aa  238  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  24.16 
 
 		 805 aa  225  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  24.26 
 
 		 806 aa  225  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  24.13 
 
 		 805 aa  214  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  24.13 
 
 		 805 aa  214  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.54 
 
 		 764 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.32 
 
 		 1051 aa  140  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.67 
 
 		 773 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.59 
 
 		 808 aa  120  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.7 
 
 		 788 aa  117  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.28 
 
 		 831 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  23.14 
 
 		 804 aa  101  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.72 
 
 		 806 aa  99.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  21.8 
 
 		 792 aa  97.4  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  22.55 
 
 		 905 aa  96.3  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  22.44 
 
 		 778 aa  96.3  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.36 
 
 		 755 aa  96.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  22.11 
 
 		 803 aa  94.7  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.76 
 
 		 807 aa  90.5  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  20.84 
 
 		 767 aa  89.7  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  21.14 
 
 		 869 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20.61 
 
 		 869 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  19.01 
 
 		 727 aa  83.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  21.18 
 
 		 864 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.27 
 
 		 807 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.03 
 
 		 811 aa  76.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  23.36 
 
 		 805 aa  75.1  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  20.49 
 
 		 765 aa  74.3  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  19.9 
 
 		 800 aa  74.3  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  20.98 
 
 		 674 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>