197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3142 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  50.25 
 
 		 799 aa  771    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  65.31 
 
 		 826 aa  1042    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  49.22 
 
 		 787 aa  714    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  51.32 
 
 		 796 aa  778    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  50.88 
 
 		 796 aa  769    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  55.19 
 
 		 827 aa  832    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  49.94 
 
 		 794 aa  763    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  53.57 
 
 		 831 aa  845    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  47.46 
 
 		 809 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  63.05 
 
 		 808 aa  948    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  53.95 
 
 		 834 aa  838    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  47.5 
 
 		 813 aa  694    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  50.13 
 
 		 793 aa  753    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  57.33 
 
 		 821 aa  874    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  44.68 
 
 		 768 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  49.48 
 
 		 795 aa  761    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  47.89 
 
 		 813 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  49.87 
 
 		 799 aa  768    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  61.78 
 
 		 813 aa  958    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  50.38 
 
 		 799 aa  773    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  50.7 
 
 		 784 aa  764    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  100 
 
 		 799 aa  1623    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  55.82 
 
 		 808 aa  852    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  57.46 
 
 		 821 aa  863    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  50.83 
 
 		 799 aa  770    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  50.19 
 
 		 790 aa  754    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  42.65 
 
 		 770 aa  630  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  44.1 
 
 		 771 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  42.25 
 
 		 772 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  43.91 
 
 		 771 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  43.91 
 
 		 771 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  43.12 
 
 		 771 aa  626  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  42.63 
 
 		 767 aa  627  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  43.72 
 
 		 771 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  43.72 
 
 		 771 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  43.85 
 
 		 771 aa  628  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  43.78 
 
 		 771 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  43.06 
 
 		 767 aa  628  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  42.93 
 
 		 772 aa  624  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  43.38 
 
 		 769 aa  618  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  44.09 
 
 		 771 aa  618  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  42.65 
 
 		 768 aa  612  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  40.99 
 
 		 784 aa  577  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  40.18 
 
 		 771 aa  569  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  38.91 
 
 		 820 aa  548  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  39.01 
 
 		 816 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  38.01 
 
 		 787 aa  508  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  39.02 
 
 		 810 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  38.05 
 
 		 794 aa  505  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  37.94 
 
 		 783 aa  482  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  36.33 
 
 		 797 aa  466  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  36.35 
 
 		 786 aa  465  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  36.02 
 
 		 786 aa  466  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  36.02 
 
 		 786 aa  466  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  36.13 
 
 		 786 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  37.29 
 
 		 804 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  36.08 
 
 		 786 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  35.92 
 
 		 804 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  36.96 
 
 		 799 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  36.26 
 
 		 786 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  36.26 
 
 		 786 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  36.26 
 
 		 786 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  35.61 
 
 		 786 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  24.78 
 
 		 797 aa  260  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  25.38 
 
 		 791 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  26.13 
 
 		 808 aa  252  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  25.66 
 
 		 790 aa  246  9e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  26.19 
 
 		 799 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  25.2 
 
 		 792 aa  231  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  26.05 
 
 		 796 aa  230  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  24.06 
 
 		 830 aa  229  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  24.18 
 
 		 805 aa  185  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  24.18 
 
 		 805 aa  185  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  24.59 
 
 		 806 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  24.34 
 
 		 805 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.82 
 
 		 808 aa  134  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.32 
 
 		 788 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.18 
 
 		 773 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.7 
 
 		 1051 aa  112  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.85 
 
 		 764 aa  110  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  22.89 
 
 		 804 aa  108  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  23.15 
 
 		 778 aa  107  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  21.02 
 
 		 727 aa  103  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.14 
 
 		 831 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20.81 
 
 		 869 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  21.67 
 
 		 869 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.46 
 
 		 905 aa  88.6  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  22.47 
 
 		 779 aa  87.8  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  20.08 
 
 		 803 aa  84.3  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.17 
 
 		 806 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  20.59 
 
 		 792 aa  74.3  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  23.81 
 
 		 756 aa  73.9  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  20.59 
 
 		 755 aa  73.9  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.18 
 
 		 807 aa  73.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.24 
 
 		 807 aa  71.2  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  21.22 
 
 		 800 aa  67.8  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  21.63 
 
 		 752 aa  66.6  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  20.08 
 
 		 692 aa  66.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  16.93 
 
 		 767 aa  65.9  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  32.88 
 
 		 752 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>