282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05360 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  100 
 
 		 727 aa  1464    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  37.39 
 
 		 692 aa  464  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  34.72 
 
 		 694 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  33.56 
 
 		 694 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.23 
 
 		 764 aa  151  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  25 
 
 		 767 aa  144  8e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  23.32 
 
 		 674 aa  134  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  22.88 
 
 		 674 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  22.05 
 
 		 795 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  20.3 
 
 		 834 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  22.41 
 
 		 792 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  23.02 
 
 		 689 aa  114  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  21.8 
 
 		 813 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  21.62 
 
 		 813 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  23.48 
 
 		 815 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  20.47 
 
 		 796 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  20.07 
 
 		 799 aa  101  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  23.29 
 
 		 778 aa  101  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  19.97 
 
 		 831 aa  100  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.65 
 
 		 755 aa  100  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  20.18 
 
 		 796 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  19.82 
 
 		 794 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  20.74 
 
 		 772 aa  97.8  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  22.5 
 
 		 784 aa  97.4  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  19.95 
 
 		 787 aa  97.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  19.13 
 
 		 816 aa  96.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  19.76 
 
 		 790 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  29.08 
 
 		 898 aa  95.9  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  22.73 
 
 		 799 aa  95.5  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  21.05 
 
 		 779 aa  95.9  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.18 
 
 		 788 aa  95.5  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  19.3 
 
 		 799 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  18.03 
 
 		 784 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  20.03 
 
 		 793 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  19.52 
 
 		 799 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  19.66 
 
 		 765 aa  94.4  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  19.34 
 
 		 799 aa  94  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  19.68 
 
 		 799 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  20.95 
 
 		 772 aa  92  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  23.83 
 
 		 764 aa  91.7  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  19.76 
 
 		 767 aa  91.3  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  20.19 
 
 		 808 aa  90.1  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.54 
 
 		 807 aa  90.1  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.08 
 
 		 811 aa  89.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  19.09 
 
 		 770 aa  89  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.63 
 
 		 1051 aa  88.6  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  21.35 
 
 		 786 aa  87.8  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  21.42 
 
 		 813 aa  87.8  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  22.65 
 
 		 779 aa  87.4  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  17.77 
 
 		 826 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  20.95 
 
 		 789 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  23.32 
 
 		 808 aa  87.4  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  21.41 
 
 		 804 aa  85.5  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  19.18 
 
 		 768 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  27.93 
 
 		 669 aa  85.1  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  19.02 
 
 		 771 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  19.15 
 
 		 767 aa  84  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  22.25 
 
 		 763 aa  83.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.13 
 
 		 807 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  20.38 
 
 		 794 aa  84  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  20.2 
 
 		 756 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  20.34 
 
 		 786 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  20.23 
 
 		 785 aa  81.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  20.68 
 
 		 872 aa  81.3  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  20.81 
 
 		 786 aa  80.9  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  20.81 
 
 		 786 aa  80.9  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  20.75 
 
 		 796 aa  80.5  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  19.76 
 
 		 787 aa  80.1  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  19.64 
 
 		 768 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  21.02 
 
 		 751 aa  79.7  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.45 
 
 		 806 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.23 
 
 		 789 aa  79  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.38 
 
 		 803 aa  79  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  21.1 
 
 		 769 aa  79  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  21.25 
 
 		 788 aa  78.6  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  19.48 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  20.35 
 
 		 835 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  18.2 
 
 		 808 aa  77.4  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  19.1 
 
 		 804 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  25 
 
 		 905 aa  76.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  20.21 
 
 		 771 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  20.43 
 
 		 778 aa  76.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  25.08 
 
 		 823 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  20.41 
 
 		 874 aa  75.1  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  19.36 
 
 		 786 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  20.48 
 
 		 788 aa  75.1  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  21.81 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  22.35 
 
 		 865 aa  74.7  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  19.19 
 
 		 786 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.98 
 
 		 831 aa  74.3  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  19.19 
 
 		 786 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  19.19 
 
 		 786 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  18.86 
 
 		 771 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  19.92 
 
 		 805 aa  72.8  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  22.45 
 
 		 1274 aa  72.8  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  24.75 
 
 		 823 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.86 
 
 		 747 aa  72.4  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  19.39 
 
 		 697 aa  72.4  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1083 aa  71.6  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  26.67 
 
 		 861 aa  71.6  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>