More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2064 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  43.26 
 
 		 767 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  58.14 
 
 		 799 aa  951    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  57.6 
 
 		 799 aa  948    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  51.49 
 
 		 826 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  42.58 
 
 		 784 aa  639    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  43.73 
 
 		 772 aa  651    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  53.89 
 
 		 787 aa  853    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  44.59 
 
 		 771 aa  659    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  58.22 
 
 		 796 aa  964    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  57.83 
 
 		 796 aa  952    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  44.91 
 
 		 767 aa  667    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  47.62 
 
 		 821 aa  728    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  58.63 
 
 		 794 aa  956    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  44.39 
 
 		 770 aa  658    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  47.54 
 
 		 831 aa  707    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  44.13 
 
 		 771 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  43.75 
 
 		 771 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  44.66 
 
 		 772 aa  667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  58.14 
 
 		 799 aa  953    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  50.51 
 
 		 808 aa  746    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  47.34 
 
 		 834 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  43.99 
 
 		 769 aa  657    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  46.19 
 
 		 827 aa  703    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  60.72 
 
 		 784 aa  981    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  100 
 
 		 795 aa  1623    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  49.48 
 
 		 799 aa  769    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  58.14 
 
 		 799 aa  952    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  44.4 
 
 		 771 aa  666    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  43.6 
 
 		 771 aa  651    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  43.46 
 
 		 768 aa  646    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  43.6 
 
 		 771 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  43.99 
 
 		 771 aa  646    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  44.52 
 
 		 768 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  47.88 
 
 		 821 aa  730    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  49.67 
 
 		 813 aa  734    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  60.08 
 
 		 793 aa  954    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  60.34 
 
 		 790 aa  956    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  44.13 
 
 		 771 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  47.47 
 
 		 808 aa  707    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  44.13 
 
 		 771 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  43.68 
 
 		 771 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  43 
 
 		 813 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  42.24 
 
 		 813 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  42.6 
 
 		 809 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  40.85 
 
 		 820 aa  594  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  41.17 
 
 		 816 aa  592  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  41.43 
 
 		 794 aa  585  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  40.21 
 
 		 787 aa  579  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  41.44 
 
 		 810 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  40.28 
 
 		 783 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  39.12 
 
 		 786 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  37.23 
 
 		 786 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  37.69 
 
 		 786 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  37.48 
 
 		 786 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  38.85 
 
 		 799 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  38 
 
 		 786 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  38.6 
 
 		 797 aa  504  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  37.44 
 
 		 786 aa  505  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  37.48 
 
 		 786 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  37.44 
 
 		 786 aa  505  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  37.66 
 
 		 804 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  37.1 
 
 		 786 aa  492  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  36.55 
 
 		 804 aa  481  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  27.79 
 
 		 797 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  26.9 
 
 		 790 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  27.75 
 
 		 791 aa  278  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  28.24 
 
 		 792 aa  271  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  27.85 
 
 		 799 aa  254  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  25.57 
 
 		 808 aa  240  5.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  24.94 
 
 		 806 aa  233  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  25.03 
 
 		 830 aa  232  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  26.23 
 
 		 796 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  24.61 
 
 		 805 aa  230  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  25.52 
 
 		 805 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  25.52 
 
 		 805 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.77 
 
 		 764 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  20.89 
 
 		 803 aa  122  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  22.98 
 
 		 727 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  19.92 
 
 		 1051 aa  116  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.15 
 
 		 808 aa  110  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  22.77 
 
 		 778 aa  107  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  20.69 
 
 		 788 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.22 
 
 		 773 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  21.54 
 
 		 804 aa  97.4  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.76 
 
 		 755 aa  95.5  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  22.87 
 
 		 905 aa  94.4  8e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  21.52 
 
 		 674 aa  92  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  19.57 
 
 		 831 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  21.44 
 
 		 674 aa  88.6  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.04 
 
 		 806 aa  88.2  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  22.09 
 
 		 792 aa  87.8  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  19.93 
 
 		 767 aa  87  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  21.49 
 
 		 800 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  26.51 
 
 		 898 aa  82.8  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  26.33 
 
 		 385 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  34.69 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  22.82 
 
 		 821 aa  77  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 385 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  18.42 
 
 		 807 aa  76.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  21.28 
 
 		 779 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>