More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08450 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  100 
 
 
764 aa  1520    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  26.71 
 
 
755 aa  265  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  25.48 
 
 
1051 aa  259  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.18 
 
 
807 aa  259  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  24.3 
 
 
778 aa  253  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  25 
 
 
790 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  31 
 
 
905 aa  239  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.59 
 
 
837 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  25.03 
 
 
808 aa  226  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  23.77 
 
 
815 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  23.47 
 
 
792 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  24.29 
 
 
791 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  23.75 
 
 
773 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  23.98 
 
 
831 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  24.63 
 
 
811 aa  211  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  23.59 
 
 
779 aa  208  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  30.15 
 
 
898 aa  206  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  25.45 
 
 
799 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  22.65 
 
 
797 aa  201  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  22.57 
 
 
803 aa  196  9e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  28.47 
 
 
861 aa  195  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  25 
 
 
796 aa  194  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.73 
 
 
808 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  23.22 
 
 
792 aa  187  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  23.71 
 
 
756 aa  187  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  25.06 
 
 
778 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  23.36 
 
 
779 aa  183  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.02 
 
 
807 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.74 
 
 
806 aa  181  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  25.57 
 
 
1359 aa  180  9e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  25.72 
 
 
1011 aa  179  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.62 
 
 
788 aa  178  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  23.83 
 
 
801 aa  177  7e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  23.52 
 
 
821 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  22.51 
 
 
821 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  23.36 
 
 
748 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  22.16 
 
 
800 aa  174  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  26.06 
 
 
1083 aa  174  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  23.43 
 
 
804 aa  172  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  26.89 
 
 
1204 aa  171  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  23.95 
 
 
767 aa  170  7e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  24.45 
 
 
869 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  24.33 
 
 
869 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  21.61 
 
 
872 aa  167  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.73 
 
 
816 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  23.14 
 
 
895 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  21.91 
 
 
835 aa  163  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  23.52 
 
 
763 aa  163  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  23.81 
 
 
751 aa  163  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  23.32 
 
 
694 aa  162  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  25.63 
 
 
674 aa  159  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  23.14 
 
 
789 aa  157  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  23.74 
 
 
755 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  22.05 
 
 
815 aa  156  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  21.02 
 
 
813 aa  156  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  24.08 
 
 
812 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  21.79 
 
 
765 aa  154  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  21.65 
 
 
787 aa  152  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  22.46 
 
 
772 aa  152  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  25.48 
 
 
874 aa  150  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  24.61 
 
 
674 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  22.54 
 
 
768 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  21.45 
 
 
824 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  22.8 
 
 
694 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  23.23 
 
 
727 aa  147  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  23.32 
 
 
770 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  23.8 
 
 
923 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  22.98 
 
 
823 aa  145  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.41 
 
 
764 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  23.88 
 
 
752 aa  144  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  20.75 
 
 
828 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  22.17 
 
 
842 aa  142  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  24.66 
 
 
747 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  27.63 
 
 
380 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  22.92 
 
 
767 aa  140  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  21.77 
 
 
788 aa  140  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  23.04 
 
 
823 aa  140  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  23.37 
 
 
862 aa  140  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  20.52 
 
 
825 aa  140  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  22.2 
 
 
879 aa  138  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.55 
 
 
756 aa  137  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  22.68 
 
 
772 aa  137  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  23.77 
 
 
785 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  20.23 
 
 
794 aa  137  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  25.34 
 
 
865 aa  137  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  22.09 
 
 
767 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  23.92 
 
 
855 aa  137  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.98 
 
 
746 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  25.22 
 
 
860 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  23.15 
 
 
758 aa  135  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  22.58 
 
 
805 aa  134  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  20.42 
 
 
794 aa  134  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  22.44 
 
 
806 aa  134  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  22.55 
 
 
823 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  21.35 
 
 
771 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  22.93 
 
 
805 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  22.93 
 
 
805 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  24.54 
 
 
692 aa  132  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  21.09 
 
 
796 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  29.04 
 
 
388 aa  132  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>