299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0610 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  100 
 
 		 807 aa  1648    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.77 
 
 		 837 aa  354  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  29.28 
 
 		 815 aa  336  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  28.07 
 
 		 801 aa  320  7e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  24.66 
 
 		 789 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  28.55 
 
 		 755 aa  286  8e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  28.57 
 
 		 764 aa  274  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  26.56 
 
 		 764 aa  265  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  24.65 
 
 		 779 aa  254  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  24.8 
 
 		 778 aa  237  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  25.81 
 
 		 800 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  24.71 
 
 		 811 aa  232  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  24.8 
 
 		 792 aa  227  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  27.19 
 
 		 756 aa  221  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  23.47 
 
 		 808 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  24.91 
 
 		 825 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  28.55 
 
 		 835 aa  213  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  25.77 
 
 		 869 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  24.81 
 
 		 773 aa  208  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.49 
 
 		 806 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  25.91 
 
 		 869 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  27.32 
 
 		 1051 aa  202  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  22.8 
 
 		 831 aa  193  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  23.71 
 
 		 788 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  28.92 
 
 		 763 aa  180  9e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  26.04 
 
 		 804 aa  180  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1083 aa  177  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.47 
 
 		 807 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  23.36 
 
 		 792 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  25.29 
 
 		 803 aa  172  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  23.2 
 
 		 788 aa  167  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  24.72 
 
 		 872 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  24.94 
 
 		 824 aa  162  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  23.34 
 
 		 821 aa  158  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  26.19 
 
 		 905 aa  157  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  24.03 
 
 		 823 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  23.79 
 
 		 823 aa  154  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.73 
 
 		 967 aa  151  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  21.86 
 
 		 797 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  23.72 
 
 		 823 aa  150  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  21.7 
 
 		 813 aa  148  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  20.47 
 
 		 791 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.81 
 
 		 816 aa  145  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  22.91 
 
 		 765 aa  144  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  21.38 
 
 		 790 aa  143  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  22.25 
 
 		 821 aa  142  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.66 
 
 		 815 aa  141  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  25.71 
 
 		 800 aa  138  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  22.56 
 
 		 830 aa  131  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  22.28 
 
 		 779 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  24.79 
 
 		 898 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  21.93 
 
 		 808 aa  128  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  20.64 
 
 		 767 aa  120  7e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  21.03 
 
 		 752 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  24.83 
 
 		 1204 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  22.34 
 
 		 828 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  24.37 
 
 		 1011 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  20.69 
 
 		 784 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  22.06 
 
 		 772 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  20.15 
 
 		 772 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  20.46 
 
 		 861 aa  107  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  21.19 
 
 		 787 aa  106  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  20.98 
 
 		 767 aa  104  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  21.63 
 
 		 771 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  22.29 
 
 		 881 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  20 
 
 		 771 aa  102  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  25.17 
 
 		 865 aa  101  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  21.89 
 
 		 752 aa  101  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  21.44 
 
 		 796 aa  100  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  20.75 
 
 		 768 aa  100  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  20.23 
 
 		 767 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  21.34 
 
 		 748 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  32.5 
 
 		 859 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  20.03 
 
 		 771 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  19.9 
 
 		 771 aa  99.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  19.9 
 
 		 771 aa  99.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  25.31 
 
 		 860 aa  99  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  23.01 
 
 		 877 aa  99  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  22.34 
 
 		 805 aa  98.6  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  22.34 
 
 		 805 aa  98.6  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  21.95 
 
 		 806 aa  98.6  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.01 
 
 		 756 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  23.35 
 
 		 694 aa  97.1  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  20.03 
 
 		 771 aa  96.3  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  20.37 
 
 		 786 aa  96.3  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  23.95 
 
 		 694 aa  96.3  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  21.95 
 
 		 805 aa  95.9  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  21.23 
 
 		 799 aa  94.7  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  19.81 
 
 		 797 aa  93.6  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  20.48 
 
 		 770 aa  92.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.97 
 
 		 717 aa  92.4  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.82 
 
 		 758 aa  91.7  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  21.26 
 
 		 783 aa  91.7  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  20.58 
 
 		 799 aa  90.5  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  19.68 
 
 		 747 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  19.82 
 
 		 768 aa  90.5  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  20.91 
 
 		 727 aa  89  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.29 
 
 		 762 aa  88.6  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  21.78 
 
 		 874 aa  88.6  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  19.77 
 
 		 771 aa  88.2  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>