More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6390 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  66.46 
 
 		 804 aa  1067    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  94.4 
 
 		 786 aa  1536    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  70.45 
 
 		 797 aa  1115    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  100 
 
 		 786 aa  1609    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  65.86 
 
 		 804 aa  1050    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  67.26 
 
 		 799 aa  1067    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  86.26 
 
 		 786 aa  1389    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  94.4 
 
 		 786 aa  1536    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  49.87 
 
 		 783 aa  728    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  85.24 
 
 		 786 aa  1398    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  85.37 
 
 		 786 aa  1400    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  46.67 
 
 		 794 aa  664    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  82.95 
 
 		 786 aa  1364    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  70.61 
 
 		 786 aa  1172    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  85.37 
 
 		 786 aa  1400    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  43.8 
 
 		 787 aa  618  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  40.36 
 
 		 784 aa  572  1e-161  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  41.91 
 
 		 772 aa  569  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  40.77 
 
 		 771 aa  570  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  41.22 
 
 		 767 aa  571  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  40.41 
 
 		 771 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  40.41 
 
 		 771 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  41.65 
 
 		 767 aa  572  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  41.18 
 
 		 768 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  40.28 
 
 		 771 aa  568  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  40.67 
 
 		 771 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  40.67 
 
 		 771 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  40.67 
 
 		 771 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  40.43 
 
 		 770 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  40.87 
 
 		 772 aa  561  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  40.8 
 
 		 769 aa  559  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  40.52 
 
 		 768 aa  561  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  41.42 
 
 		 771 aa  556  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  40.54 
 
 		 771 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  40.15 
 
 		 771 aa  558  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  38.06 
 
 		 799 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  37.68 
 
 		 799 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  37.68 
 
 		 799 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  37.68 
 
 		 799 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  38.08 
 
 		 794 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  37.29 
 
 		 790 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  37.42 
 
 		 793 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  38.47 
 
 		 784 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  39.79 
 
 		 820 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  36.55 
 
 		 796 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  37.07 
 
 		 796 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  38.35 
 
 		 816 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  37.1 
 
 		 795 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  35.93 
 
 		 787 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  38.92 
 
 		 808 aa  478  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  39.82 
 
 		 810 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  37.47 
 
 		 826 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  37.32 
 
 		 813 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  37.15 
 
 		 821 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  36.08 
 
 		 799 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  37.37 
 
 		 821 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  38.43 
 
 		 813 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  36.64 
 
 		 813 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  37.85 
 
 		 831 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  37.74 
 
 		 809 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  37.52 
 
 		 808 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  36.12 
 
 		 834 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  35.43 
 
 		 827 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  26.94 
 
 		 797 aa  265  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  28.16 
 
 		 799 aa  254  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  27.23 
 
 		 791 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  25.73 
 
 		 808 aa  244  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  26.53 
 
 		 796 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  25.67 
 
 		 790 aa  241  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  27.73 
 
 		 792 aa  224  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  25.83 
 
 		 830 aa  198  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  25.51 
 
 		 805 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  25.28 
 
 		 806 aa  184  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  24.42 
 
 		 805 aa  171  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  24.42 
 
 		 805 aa  171  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.08 
 
 		 755 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.18 
 
 		 764 aa  105  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.57 
 
 		 788 aa  88.2  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  19.85 
 
 		 773 aa  84.7  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.79 
 
 		 746 aa  84.3  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  19.9 
 
 		 831 aa  84.3  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  21.14 
 
 		 727 aa  82.4  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  21.27 
 
 		 864 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  22.34 
 
 		 752 aa  78.2  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  23.42 
 
 		 752 aa  78.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  20.26 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.02 
 
 		 758 aa  75.5  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  18.25 
 
 		 767 aa  74.7  0.000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  19.51 
 
 		 806 aa  71.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  24.09 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  20.35 
 
 		 1051 aa  69.7  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  20.48 
 
 		 869 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  21.05 
 
 		 800 aa  68.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20.18 
 
 		 869 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  26.48 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  20.81 
 
 		 765 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  21.49 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  20.3 
 
 		 905 aa  65.5  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1048 aa  65.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.4 
 
 		 808 aa  65.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>