More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0222 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  49.87 
 
 		 777 aa  762    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  100 
 
 		 746 aa  1504    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  52.07 
 
 		 747 aa  810    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  46.51 
 
 		 758 aa  677    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  48.64 
 
 		 756 aa  706    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  48.07 
 
 		 752 aa  701    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  50.13 
 
 		 777 aa  777    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  41.22 
 
 		 752 aa  625  1e-178  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  34.83 
 
 		 748 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  33.51 
 
 		 812 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  31.66 
 
 		 778 aa  392  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  31.96 
 
 		 755 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  31.67 
 
 		 864 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  26.48 
 
 		 821 aa  192  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  23.23 
 
 		 865 aa  188  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  26.63 
 
 		 889 aa  171  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  25.72 
 
 		 687 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.98 
 
 		 764 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  23.33 
 
 		 805 aa  137  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  29.37 
 
 		 385 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  23.46 
 
 		 895 aa  130  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  29.02 
 
 		 385 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  29.62 
 
 		 385 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  24.27 
 
 		 923 aa  126  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  30.08 
 
 		 387 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  23.83 
 
 		 1359 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  23.5 
 
 		 1204 aa  118  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  25.74 
 
 		 388 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  26.41 
 
 		 380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  24.11 
 
 		 755 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  24.56 
 
 		 921 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  22.99 
 
 		 842 aa  99.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  24.45 
 
 		 786 aa  99.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  24.45 
 
 		 786 aa  98.2  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  24.45 
 
 		 786 aa  98.2  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  21.58 
 
 		 835 aa  97.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  19.1 
 
 		 778 aa  96.3  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  22.54 
 
 		 831 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  23.79 
 
 		 1051 aa  93.6  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.02 
 
 		 806 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  24.3 
 
 		 786 aa  91.3  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  23.72 
 
 		 786 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  23.72 
 
 		 786 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  22.93 
 
 		 807 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.03 
 
 		 816 aa  84.3  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  22.28 
 
 		 788 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  23.59 
 
 		 786 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  32.19 
 
 		 874 aa  82.8  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  21.24 
 
 		 811 aa  81.6  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  23.79 
 
 		 786 aa  81.6  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.18 
 
 		 800 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  21.47 
 
 		 784 aa  80.1  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  33.07 
 
 		 1131 aa  78.2  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  32.69 
 
 		 862 aa  77.4  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.94 
 
 		 773 aa  77.4  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  20.4 
 
 		 756 aa  76.6  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  23.75 
 
 		 695 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.91 
 
 		 807 aa  75.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  19.53 
 
 		 815 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  30.28 
 
 		 1011 aa  75.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  20.76 
 
 		 797 aa  75.5  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  19.85 
 
 		 789 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  20.38 
 
 		 815 aa  75.1  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  24.38 
 
 		 832 aa  75.5  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  22.83 
 
 		 787 aa  73.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  22.68 
 
 		 779 aa  72.8  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  22.49 
 
 		 772 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  22.79 
 
 		 849 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  20.73 
 
 		 685 aa  72.4  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.04 
 
 		 808 aa  72.4  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  19.97 
 
 		 825 aa  72.4  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  29.68 
 
 		 855 aa  72  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  29.24 
 
 		 910 aa  71.2  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  22.98 
 
 		 799 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  19.82 
 
 		 797 aa  70.9  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  18.69 
 
 		 788 aa  70.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  20.33 
 
 		 981 aa  70.1  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  21.48 
 
 		 684 aa  68.2  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  19.23 
 
 		 804 aa  68.2  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  21.4 
 
 		 786 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  23.63 
 
 		 821 aa  67.8  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  23.41 
 
 		 727 aa  67.8  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.51 
 
 		 905 aa  67.8  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  24.4 
 
 		 964 aa  67.8  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.7 
 
 		 717 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  22.55 
 
 		 974 aa  67  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  18.56 
 
 		 788 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  22.71 
 
 		 799 aa  67  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.11 
 
 		 1109 aa  66.6  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  22.41 
 
 		 861 aa  67.4  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  30.41 
 
 		 872 aa  66.6  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.05 
 
 		 723 aa  66.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  22.2 
 
 		 771 aa  65.1  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  21.47 
 
 		 813 aa  65.1  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  28.51 
 
 		 737 aa  64.7  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2167  RND superfamily drug efflux protein  28.18 
 
 		 825 aa  64.7  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00341827 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  29.73 
 
 		 694 aa  64.7  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  21.85 
 
 		 797 aa  64.7  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  22.89 
 
 		 972 aa  64.7  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  24.32 
 
 		 865 aa  63.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>