More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4897 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  100 
 
 		 864 aa  1754    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  33.44 
 
 		 748 aa  355  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  30.64 
 
 		 812 aa  320  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  29.28 
 
 		 777 aa  315  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  30.34 
 
 		 752 aa  301  5e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  28.26 
 
 		 777 aa  299  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  31.68 
 
 		 756 aa  297  5e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  32.17 
 
 		 758 aa  296  8e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  30.96 
 
 		 755 aa  295  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  31.67 
 
 		 746 aa  288  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  32.97 
 
 		 747 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  28.05 
 
 		 778 aa  278  4e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  27.89 
 
 		 752 aa  269  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  25.73 
 
 		 821 aa  239  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  25.9 
 
 		 687 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  25.94 
 
 		 889 aa  219  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  23.33 
 
 		 865 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  24.22 
 
 		 832 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  29.69 
 
 		 921 aa  144  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  22.55 
 
 		 923 aa  137  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.1 
 
 		 1359 aa  131  7.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  22.3 
 
 		 805 aa  124  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  22.16 
 
 		 874 aa  121  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  24.5 
 
 		 1204 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  24.33 
 
 		 380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.62 
 
 		 764 aa  111  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  22.11 
 
 		 831 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  23.06 
 
 		 1051 aa  110  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  22.29 
 
 		 825 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  22.09 
 
 		 768 aa  101  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  21.91 
 
 		 855 aa  99.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  22.55 
 
 		 385 aa  99.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  21.76 
 
 		 385 aa  98.6  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.16 
 
 		 872 aa  98.2  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  21.47 
 
 		 385 aa  96.3  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  23.58 
 
 		 789 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  23.05 
 
 		 788 aa  94.7  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  22.73 
 
 		 767 aa  93.6  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  23.34 
 
 		 799 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  22.9 
 
 		 794 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.6 
 
 		 773 aa  91.3  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.75 
 
 		 806 aa  90.9  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  23.56 
 
 		 799 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  23.56 
 
 		 799 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  21.86 
 
 		 771 aa  89  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  22.43 
 
 		 796 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  25.49 
 
 		 388 aa  88.6  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  22.01 
 
 		 771 aa  88.2  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  22.01 
 
 		 771 aa  88.2  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  22.18 
 
 		 796 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  21.56 
 
 		 799 aa  87  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  23.14 
 
 		 788 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  23.46 
 
 		 771 aa  87  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  22.18 
 
 		 770 aa  87  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  22.5 
 
 		 799 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  21.37 
 
 		 816 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  20.31 
 
 		 771 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  21.94 
 
 		 790 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  22.8 
 
 		 772 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  21.81 
 
 		 771 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  22.07 
 
 		 771 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  21.81 
 
 		 771 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  21.81 
 
 		 771 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  21.81 
 
 		 771 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  31.08 
 
 		 862 aa  84.7  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  21.2 
 
 		 786 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  20.75 
 
 		 793 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  21.2 
 
 		 786 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  24.15 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  21.97 
 
 		 804 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  22.51 
 
 		 788 aa  84.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  21.2 
 
 		 786 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  32 
 
 		 1040 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  20.26 
 
 		 787 aa  83.2  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  23.01 
 
 		 767 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  32.67 
 
 		 1022 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  32.67 
 
 		 1022 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  29.8 
 
 		 895 aa  82.8  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  32.67 
 
 		 681 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  21.73 
 
 		 799 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  21.77 
 
 		 821 aa  81.6  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  32 
 
 		 1028 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  34.44 
 
 		 1011 aa  81.3  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  23.41 
 
 		 694 aa  81.3  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  22.13 
 
 		 786 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  22.13 
 
 		 786 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  21.27 
 
 		 786 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.43 
 
 		 755 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  30.14 
 
 		 1011 aa  80.1  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  21.79 
 
 		 797 aa  78.2  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  20.98 
 
 		 786 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  20.22 
 
 		 786 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  21.86 
 
 		 769 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  21.18 
 
 		 768 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  30.16 
 
 		 1131 aa  77  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  20.81 
 
 		 786 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  28.97 
 
 		 981 aa  76.3  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  29.22 
 
 		 974 aa  77  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  29.14 
 
 		 974 aa  76.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  31.58 
 
 		 1077 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>