268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1238 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  55.26 
 
 		 862 aa  881    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  100 
 
 		 855 aa  1683    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  64.18 
 
 		 872 aa  1000    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  66.47 
 
 		 862 aa  1058    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  41.47 
 
 		 895 aa  629  1e-179  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  40.76 
 
 		 1011 aa  531  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  42.14 
 
 		 1131 aa  520  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  41.25 
 
 		 1204 aa  514  1e-144  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  35.58 
 
 		 874 aa  462  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  36.06 
 
 		 1109 aa  460  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  33.76 
 
 		 860 aa  335  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  31.9 
 
 		 842 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  31.64 
 
 		 805 aa  326  9e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  32.11 
 
 		 1359 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  28.7 
 
 		 923 aa  310  8e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  28.24 
 
 		 832 aa  278  4e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  31.15 
 
 		 879 aa  271  4e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.99 
 
 		 764 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  25.37 
 
 		 385 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  22.61 
 
 		 864 aa  119  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  30.17 
 
 		 388 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  26.35 
 
 		 385 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  21.61 
 
 		 748 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  25 
 
 		 380 aa  115  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  25.86 
 
 		 385 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  24.03 
 
 		 752 aa  112  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  24.61 
 
 		 778 aa  108  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.78 
 
 		 747 aa  107  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  23.2 
 
 		 1051 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.84 
 
 		 815 aa  101  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.41 
 
 		 812 aa  100  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  27.18 
 
 		 387 aa  98.2  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.29 
 
 		 807 aa  89.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.84 
 
 		 756 aa  87.8  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.13 
 
 		 778 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  27.38 
 
 		 835 aa  84.3  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  21.96 
 
 		 755 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.16 
 
 		 758 aa  82.4  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.84 
 
 		 807 aa  79  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  23.67 
 
 		 752 aa  79  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  27.27 
 
 		 825 aa  79  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  23.18 
 
 		 687 aa  78.2  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.15 
 
 		 806 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  26.51 
 
 		 755 aa  76.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.12 
 
 		 789 aa  75.1  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  21.7 
 
 		 821 aa  75.1  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  22.26 
 
 		 756 aa  72.4  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  25.26 
 
 		 821 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  30.35 
 
 		 839 aa  72  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  29.68 
 
 		 746 aa  72.4  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  23.51 
 
 		 792 aa  72  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  29.73 
 
 		 859 aa  72  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  23.42 
 
 		 865 aa  72  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  26.46 
 
 		 821 aa  71.6  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  36.72 
 
 		 845 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.48 
 
 		 895 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  25.35 
 
 		 815 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  22.28 
 
 		 816 aa  70.1  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  27.47 
 
 		 905 aa  68.2  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  26.09 
 
 		 777 aa  68.2  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  21.51 
 
 		 828 aa  67.4  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.04 
 
 		 882 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  29.22 
 
 		 777 aa  67  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  32.37 
 
 		 862 aa  66.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.04 
 
 		 669 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  33.88 
 
 		 921 aa  65.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  29.11 
 
 		 889 aa  65.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  29.1 
 
 		 861 aa  65.5  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.54 
 
 		 1045 aa  65.1  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.41 
 
 		 882 aa  65.1  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  25.91 
 
 		 843 aa  65.1  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  28.21 
 
 		 920 aa  64.3  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.97 
 
 		 1291 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  23.65 
 
 		 831 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  22.64 
 
 		 684 aa  63.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  28.18 
 
 		 899 aa  62.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  27.81 
 
 		 893 aa  62.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  27.93 
 
 		 865 aa  62.4  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  22.4 
 
 		 790 aa  62.4  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.79 
 
 		 868 aa  62  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.19 
 
 		 882 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  27.85 
 
 		 1028 aa  62  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  25.74 
 
 		 1040 aa  61.6  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  24.75 
 
 		 872 aa  61.6  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.28 
 
 		 883 aa  61.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  21.27 
 
 		 792 aa  61.2  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  28.65 
 
 		 889 aa  61.2  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  26.16 
 
 		 1022 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  26.16 
 
 		 1022 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  20.83 
 
 		 898 aa  60.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  20.63 
 
 		 1083 aa  60.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  28.17 
 
 		 773 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.04 
 
 		 883 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.6 
 
 		 808 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  27.37 
 
 		 906 aa  59.7  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  28.34 
 
 		 1128 aa  60.1  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  25.47 
 
 		 800 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.67 
 
 		 882 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  31.33 
 
 		 972 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  33.09 
 
 		 792 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>