More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1059 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  48.86 
 
 		 756 aa  712    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  51.45 
 
 		 747 aa  795    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  46.14 
 
 		 758 aa  665    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  44.44 
 
 		 752 aa  672    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  50.53 
 
 		 746 aa  761    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  73.97 
 
 		 777 aa  1204    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  100 
 
 		 777 aa  1587    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  39.27 
 
 		 752 aa  587  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  33.69 
 
 		 748 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  34.32 
 
 		 812 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  33.65 
 
 		 755 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  33.14 
 
 		 778 aa  380  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  28.26 
 
 		 864 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  24.78 
 
 		 865 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  25.75 
 
 		 821 aa  181  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  23.35 
 
 		 889 aa  171  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  23.78 
 
 		 687 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  25.2 
 
 		 385 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  25.46 
 
 		 385 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  25.2 
 
 		 385 aa  125  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  25.34 
 
 		 380 aa  124  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  26.67 
 
 		 387 aa  124  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  24.23 
 
 		 388 aa  117  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.24 
 
 		 764 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  24.32 
 
 		 1051 aa  110  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  22.58 
 
 		 921 aa  103  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  23.24 
 
 		 1204 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  23.27 
 
 		 831 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  22.42 
 
 		 805 aa  95.9  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.19 
 
 		 773 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  22.17 
 
 		 842 aa  90.1  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.67 
 
 		 755 aa  88.6  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  22.13 
 
 		 788 aa  85.9  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  22.29 
 
 		 862 aa  82.4  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  29.17 
 
 		 923 aa  79  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  28.93 
 
 		 1359 aa  76.3  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  27.89 
 
 		 1131 aa  75.1  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  22.83 
 
 		 981 aa  75.1  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  25.41 
 
 		 895 aa  74.7  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  27.67 
 
 		 1011 aa  73.9  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  24.38 
 
 		 832 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  32.35 
 
 		 1109 aa  73.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  22.77 
 
 		 974 aa  73.2  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  25.99 
 
 		 874 aa  72  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  21.7 
 
 		 920 aa  68.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  22.26 
 
 		 779 aa  69.3  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  26.09 
 
 		 855 aa  68.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1083 aa  68.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.23 
 
 		 807 aa  68.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  29.68 
 
 		 862 aa  68.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  28.87 
 
 		 893 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  30.58 
 
 		 879 aa  66.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  22.86 
 
 		 730 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  23.75 
 
 		 795 aa  65.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  22.86 
 
 		 730 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  30.11 
 
 		 910 aa  64.3  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  26.39 
 
 		 793 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  25.24 
 
 		 821 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  25.84 
 
 		 972 aa  63.5  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  26.71 
 
 		 734 aa  63.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  23.73 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  26.11 
 
 		 872 aa  63.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  20.66 
 
 		 1001 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  21.45 
 
 		 730 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  18.59 
 
 		 756 aa  62  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.26 
 
 		 886 aa  61.6  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  18.54 
 
 		 806 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  25.28 
 
 		 898 aa  61.2  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.96 
 
 		 872 aa  61.6  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  22.13 
 
 		 974 aa  61.6  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  21.73 
 
 		 717 aa  61.6  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  27.98 
 
 		 740 aa  61.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  23.08 
 
 		 968 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  22.1 
 
 		 861 aa  60.8  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  22.55 
 
 		 815 aa  60.8  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  25.98 
 
 		 821 aa  60.8  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  21.47 
 
 		 944 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  22.62 
 
 		 967 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.72 
 
 		 804 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  23.51 
 
 		 872 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  25.68 
 
 		 845 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  24.88 
 
 		 709 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  32.61 
 
 		 862 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  24.06 
 
 		 881 aa  59.3  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1909  hypothetical protein  26.25 
 
 		 692 aa  58.9  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00515667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  27.42 
 
 		 730 aa  58.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.42 
 
 		 730 aa  58.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  27.42 
 
 		 730 aa  58.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  27.42 
 
 		 730 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  23.1 
 
 		 962 aa  58.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  24.14 
 
 		 813 aa  58.2  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  24.89 
 
 		 723 aa  58.2  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.34 
 
 		 807 aa  58.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  20.99 
 
 		 758 aa  58.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  26.71 
 
 		 778 aa  57.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.82 
 
 		 723 aa  57.8  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  22.55 
 
 		 748 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  22.55 
 
 		 754 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  21.82 
 
 		 964 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  22.93 
 
 		 751 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>