130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3168 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  100 
 
 		 723 aa  1465    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  39.17 
 
 		 717 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  22.34 
 
 		 764 aa  184  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  27.11 
 
 		 779 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  23.86 
 
 		 792 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  22.95 
 
 		 800 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  23.09 
 
 		 811 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  25.04 
 
 		 765 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  22.31 
 
 		 778 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  22.96 
 
 		 807 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  23.42 
 
 		 756 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.34 
 
 		 755 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.61 
 
 		 807 aa  97.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  22.12 
 
 		 905 aa  92  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  19.58 
 
 		 831 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  20.45 
 
 		 825 aa  88.6  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.62 
 
 		 764 aa  88.2  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  22 
 
 		 800 aa  85.1  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  20.59 
 
 		 816 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.4 
 
 		 788 aa  77.8  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  19.44 
 
 		 869 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  19.67 
 
 		 773 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  18.78 
 
 		 869 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  23.51 
 
 		 860 aa  73.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  22.09 
 
 		 821 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  22.13 
 
 		 388 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  20.9 
 
 		 881 aa  72.4  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  19.55 
 
 		 752 aa  72  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  21.96 
 
 		 385 aa  72  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.48 
 
 		 756 aa  72  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  19.6 
 
 		 801 aa  69.7  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  20.36 
 
 		 828 aa  69.7  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.76 
 
 		 1359 aa  69.7  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.56 
 
 		 746 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.49 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.46 
 
 		 837 aa  68.6  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  22.44 
 
 		 777 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.39 
 
 		 758 aa  67.4  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  20.98 
 
 		 796 aa  65.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  20.35 
 
 		 824 aa  65.5  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  20.18 
 
 		 777 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.72 
 
 		 789 aa  64.7  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  21.14 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  23.22 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  21.32 
 
 		 779 aa  63.9  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  19.89 
 
 		 747 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.66 
 
 		 808 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  20.23 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  19.66 
 
 		 789 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  20.55 
 
 		 865 aa  60.8  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  21.55 
 
 		 861 aa  60.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0528  RND superfamily transporter  19.66 
 
 		 789 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  26.69 
 
 		 748 aa  59.3  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  28.37 
 
 		 1109 aa  58.5  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.64 
 
 		 967 aa  58.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  20.18 
 
 		 797 aa  57.8  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  20.17 
 
 		 788 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  20.06 
 
 		 727 aa  57  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  20.78 
 
 		 778 aa  56.2  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  27.91 
 
 		 689 aa  56.2  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  26.03 
 
 		 862 aa  55.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  31.31 
 
 		 874 aa  55.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  18.6 
 
 		 821 aa  55.8  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  19.83 
 
 		 813 aa  55.8  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  25.14 
 
 		 895 aa  55.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  25.93 
 
 		 1204 aa  55.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  20.22 
 
 		 835 aa  55.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  32.76 
 
 		 823 aa  55.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  19.55 
 
 		 752 aa  54.7  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24 
 
 		 798 aa  54.3  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  20.29 
 
 		 797 aa  53.9  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  32.76 
 
 		 823 aa  54.3  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  32.76 
 
 		 823 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  21.52 
 
 		 872 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  19.26 
 
 		 788 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0221  RND efflux transporter  23.64 
 
 		 771 aa  53.9  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.822518  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  17.39 
 
 		 767 aa  52.4  0.00003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  28.03 
 
 		 697 aa  52  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  24.66 
 
 		 855 aa  51.6  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  20.78 
 
 		 1131 aa  51.6  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  19.32 
 
 		 730 aa  51.6  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  18.58 
 
 		 380 aa  51.2  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  20.06 
 
 		 730 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  20.73 
 
 		 730 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  22.98 
 
 		 831 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  21.88 
 
 		 783 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  26.2 
 
 		 879 aa  50.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  22.99 
 
 		 803 aa  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  19.88 
 
 		 788 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  25.48 
 
 		 751 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  24.38 
 
 		 862 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  21.31 
 
 		 387 aa  50.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  25 
 
 		 812 aa  48.9  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1695  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.79 
 
 		 782 aa  48.9  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  18.33 
 
 		 898 aa  48.1  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  16.67 
 
 		 877 aa  48.1  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  18.75 
 
 		 730 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  22.28 
 
 		 864 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  19.94 
 
 		 730 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  19.94 
 
 		 730 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>