80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2562 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  100 
 
 		 697 aa  1365    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  24.49 
 
 		 789 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  24.05 
 
 		 788 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  24.01 
 
 		 788 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  24.05 
 
 		 797 aa  144  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  23.85 
 
 		 789 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  23.5 
 
 		 785 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  22.88 
 
 		 796 aa  124  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  23.48 
 
 		 787 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  22.68 
 
 		 797 aa  114  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  24.77 
 
 		 755 aa  103  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.46 
 
 		 837 aa  95.9  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0528  RND superfamily transporter  27.62 
 
 		 789 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.38 
 
 		 762 aa  79.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  18.44 
 
 		 788 aa  78.2  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  19.8 
 
 		 803 aa  75.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  23.86 
 
 		 792 aa  75.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  22.2 
 
 		 779 aa  73.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.09 
 
 		 831 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  22.4 
 
 		 778 aa  72  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  22.18 
 
 		 694 aa  71.6  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  25.76 
 
 		 815 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  24.01 
 
 		 825 aa  70.1  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  20.87 
 
 		 815 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  19.45 
 
 		 764 aa  69.3  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  19.68 
 
 		 727 aa  68.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  20.85 
 
 		 789 aa  67.4  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  19.24 
 
 		 816 aa  67.4  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  22.54 
 
 		 800 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  22.22 
 
 		 801 aa  65.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.24 
 
 		 807 aa  65.1  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  23.44 
 
 		 800 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.59 
 
 		 807 aa  63.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  20.27 
 
 		 861 aa  62.4  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  27.68 
 
 		 835 aa  60.1  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  21.05 
 
 		 804 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  29.94 
 
 		 811 aa  59.3  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  19.53 
 
 		 692 aa  58.9  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  25.51 
 
 		 899 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  17.08 
 
 		 808 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  22.69 
 
 		 764 aa  57.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  24.36 
 
 		 1128 aa  57.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.03 
 
 		 773 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.95 
 
 		 883 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.66 
 
 		 717 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  24.76 
 
 		 1155 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.94 
 
 		 806 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  19.8 
 
 		 694 aa  55.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  24.29 
 
 		 821 aa  55.1  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.42 
 
 		 883 aa  54.7  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  25.44 
 
 		 872 aa  54.7  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  22.51 
 
 		 788 aa  54.3  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  18.32 
 
 		 828 aa  54.3  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  24.46 
 
 		 920 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  29.31 
 
 		 776 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  26.47 
 
 		 892 aa  52.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  28.5 
 
 		 756 aa  50.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  23.56 
 
 		 824 aa  50.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  27.31 
 
 		 731 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  27.24 
 
 		 727 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  23.25 
 
 		 862 aa  48.9  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  30 
 
 		 751 aa  49.3  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  21.02 
 
 		 898 aa  48.1  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.95 
 
 		 967 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  29.14 
 
 		 845 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  23.85 
 
 		 860 aa  47.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  25.6 
 
 		 859 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  24.26 
 
 		 890 aa  45.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  20.58 
 
 		 905 aa  45.4  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0788  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1019 aa  45.4  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  17.88 
 
 		 813 aa  45.4  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1041 aa  45.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  24 
 
 		 748 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  23.75 
 
 		 865 aa  45.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  26.22 
 
 		 743 aa  44.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  25.68 
 
 		 751 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  29.59 
 
 		 752 aa  44.7  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  25.36 
 
 		 893 aa  44.3  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  32.22 
 
 		 855 aa  43.9  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2927  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1009 aa  43.9  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>