161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2963 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0528  RND superfamily transporter  61.65 
 
 		 789 aa  924    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  77.85 
 
 		 797 aa  1223    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  80.62 
 
 		 788 aa  1262    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  83.01 
 
 		 789 aa  1296    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  80.43 
 
 		 788 aa  1258    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  80.53 
 
 		 787 aa  1189    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  79.18 
 
 		 789 aa  1250    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  100 
 
 		 785 aa  1570    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  68.89 
 
 		 796 aa  1081    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  66.75 
 
 		 797 aa  1013    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.05 
 
 		 808 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  19.81 
 
 		 806 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.93 
 
 		 764 aa  137  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  23.25 
 
 		 697 aa  120  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.61 
 
 		 755 aa  115  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  19.18 
 
 		 831 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  23.01 
 
 		 792 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  19.4 
 
 		 773 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  22.18 
 
 		 779 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  21.64 
 
 		 835 aa  99.4  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.39 
 
 		 815 aa  97.4  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  25.12 
 
 		 811 aa  94.4  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.92 
 
 		 788 aa  94.4  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  21.44 
 
 		 828 aa  93.6  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.63 
 
 		 778 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  22 
 
 		 752 aa  93.2  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.78 
 
 		 837 aa  93.2  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  19.75 
 
 		 789 aa  92.4  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  22.4 
 
 		 800 aa  89.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.27 
 
 		 967 aa  86.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  19.12 
 
 		 807 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  20.62 
 
 		 825 aa  85.1  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  22.72 
 
 		 765 aa  84  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.16 
 
 		 762 aa  82.4  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  22.54 
 
 		 779 aa  82  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  18.94 
 
 		 803 aa  80.5  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  22.57 
 
 		 820 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  22.04 
 
 		 752 aa  80.9  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  19.14 
 
 		 821 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  21.27 
 
 		 821 aa  78.2  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  20.89 
 
 		 727 aa  77.4  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  19.77 
 
 		 813 aa  77.4  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  25.88 
 
 		 751 aa  76.6  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  18.84 
 
 		 872 aa  75.1  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.54 
 
 		 807 aa  75.1  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  19.63 
 
 		 804 aa  74.3  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  20.51 
 
 		 756 aa  72.8  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  20.18 
 
 		 823 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  19.75 
 
 		 824 aa  71.2  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.64 
 
 		 1051 aa  70.5  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  20.85 
 
 		 864 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  21.84 
 
 		 767 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  20.03 
 
 		 823 aa  70.1  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  23 
 
 		 786 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.69 
 
 		 776 aa  68.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  20.25 
 
 		 823 aa  67  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  21.32 
 
 		 796 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  23.05 
 
 		 779 aa  67  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  17.88 
 
 		 756 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  21.24 
 
 		 797 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  21.08 
 
 		 799 aa  66.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.97 
 
 		 800 aa  65.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  22.69 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  18.5 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  30.25 
 
 		 804 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  23.2 
 
 		 764 aa  64.7  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  21.6 
 
 		 796 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  20.55 
 
 		 794 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.05 
 
 		 801 aa  64.3  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  20.64 
 
 		 831 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  26.92 
 
 		 786 aa  62  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  23.12 
 
 		 790 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  25.54 
 
 		 787 aa  61.6  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  23.02 
 
 		 826 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  22.73 
 
 		 786 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  28.38 
 
 		 797 aa  60.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  22.73 
 
 		 786 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  22.63 
 
 		 786 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  19.61 
 
 		 746 aa  60.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  20.71 
 
 		 816 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  22.95 
 
 		 793 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  22.12 
 
 		 815 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  28.1 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  24.86 
 
 		 794 aa  59.3  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  21.84 
 
 		 786 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  21.84 
 
 		 786 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  22.61 
 
 		 860 aa  58.5  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  20.55 
 
 		 778 aa  58.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  30.56 
 
 		 859 aa  58.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  23.09 
 
 		 758 aa  58.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  22.91 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  26.67 
 
 		 786 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  23.15 
 
 		 741 aa  58.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  30 
 
 		 804 aa  57.4  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  26.2 
 
 		 812 aa  57.4  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  20.76 
 
 		 767 aa  57  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  25.84 
 
 		 799 aa  56.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  21.21 
 
 		 694 aa  56.6  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  19.76 
 
 		 748 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  18.29 
 
 		 755 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>