279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1279 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  48.77 
 
 		 815 aa  736    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  61.52 
 
 		 823 aa  931    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  61.14 
 
 		 823 aa  922    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  61.23 
 
 		 823 aa  931    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  48.41 
 
 		 813 aa  749    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  50.25 
 
 		 816 aa  783    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  100 
 
 		 821 aa  1641    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  49.33 
 
 		 821 aa  753    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  40.48 
 
 		 824 aa  602  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  41.22 
 
 		 828 aa  598  1e-169  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  38.96 
 
 		 835 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  36.4 
 
 		 825 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  35.51 
 
 		 859 aa  501  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  35.77 
 
 		 872 aa  486  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  32.04 
 
 		 807 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  30.56 
 
 		 800 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  24.51 
 
 		 755 aa  230  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  24.25 
 
 		 815 aa  211  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  24.69 
 
 		 778 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.68 
 
 		 837 aa  189  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  23.7 
 
 		 808 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.52 
 
 		 764 aa  181  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  23.01 
 
 		 773 aa  165  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.74 
 
 		 831 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  21.83 
 
 		 788 aa  156  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.89 
 
 		 807 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  23.42 
 
 		 788 aa  154  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.73 
 
 		 967 aa  150  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  25.61 
 
 		 756 aa  145  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.61 
 
 		 806 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  22.44 
 
 		 801 aa  141  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.05 
 
 		 800 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  22.75 
 
 		 804 aa  128  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.12 
 
 		 762 aa  127  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  21.31 
 
 		 1083 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  21.33 
 
 		 1359 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  19.93 
 
 		 1051 aa  119  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  20.4 
 
 		 865 aa  118  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  18.42 
 
 		 860 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  20.36 
 
 		 779 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.72 
 
 		 803 aa  117  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.05 
 
 		 764 aa  116  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.93 
 
 		 811 aa  115  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  24.39 
 
 		 767 aa  115  5e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  22.63 
 
 		 789 aa  111  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  20.91 
 
 		 789 aa  111  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  21.55 
 
 		 763 aa  110  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.7 
 
 		 898 aa  108  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  21.99 
 
 		 751 aa  108  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  19.9 
 
 		 788 aa  108  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  22.22 
 
 		 789 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  18.83 
 
 		 877 aa  100  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  19.25 
 
 		 797 aa  100  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  22.18 
 
 		 778 aa  100  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  22.08 
 
 		 905 aa  99  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  19.66 
 
 		 788 aa  99  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  26.22 
 
 		 385 aa  97.8  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  20.05 
 
 		 765 aa  97.4  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  25.87 
 
 		 385 aa  96.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  26.3 
 
 		 385 aa  94  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  21.77 
 
 		 864 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  19.27 
 
 		 792 aa  91.7  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  22.75 
 
 		 694 aa  91.7  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  20.3 
 
 		 779 aa  90.9  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  20.64 
 
 		 784 aa  90.1  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  18.89 
 
 		 797 aa  88.6  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  19.79 
 
 		 790 aa  87.4  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.06 
 
 		 717 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  22.18 
 
 		 694 aa  87  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  22.39 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.98 
 
 		 812 aa  85.5  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  19.58 
 
 		 796 aa  84.3  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  19.5 
 
 		 785 aa  84.7  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  29.32 
 
 		 923 aa  83.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20.85 
 
 		 869 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  21.13 
 
 		 792 aa  83.2  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  19.17 
 
 		 797 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  25.51 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  22.91 
 
 		 692 aa  82  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  25 
 
 		 748 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  24.09 
 
 		 861 aa  80.9  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  20.43 
 
 		 869 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  22.21 
 
 		 794 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  19.95 
 
 		 674 aa  80.1  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  20.84 
 
 		 796 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  21.85 
 
 		 752 aa  78.2  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  22.41 
 
 		 799 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  21.14 
 
 		 796 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  20.45 
 
 		 786 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  26.19 
 
 		 855 aa  77.4  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  21.24 
 
 		 1011 aa  76.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  22.76 
 
 		 795 aa  75.5  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.27 
 
 		 756 aa  74.7  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  21.22 
 
 		 832 aa  74.7  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  24.15 
 
 		 747 aa  74.3  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  26.74 
 
 		 1204 aa  74.3  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  27.09 
 
 		 879 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  21.08 
 
 		 771 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  21.08 
 
 		 771 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  24.15 
 
 		 895 aa  72.4  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>