223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0109 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  94.36 
 
 		 674 aa  1254    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  100 
 
 		 674 aa  1335    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  49.62 
 
 		 669 aa  594  1e-168  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  41.16 
 
 		 689 aa  470  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  24.85 
 
 		 694 aa  169  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  25.76 
 
 		 764 aa  162  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  24.11 
 
 		 694 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  22.88 
 
 		 727 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  23.39 
 
 		 692 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  23.62 
 
 		 790 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  23.11 
 
 		 793 aa  106  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  23.12 
 
 		 784 aa  101  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.73 
 
 		 755 aa  98.6  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  22.29 
 
 		 799 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  24.04 
 
 		 794 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  22.37 
 
 		 799 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  22.48 
 
 		 799 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  22.03 
 
 		 796 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  22.26 
 
 		 799 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.78 
 
 		 767 aa  94.4  6e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  21.65 
 
 		 796 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  21.36 
 
 		 795 aa  92.8  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  21.06 
 
 		 756 aa  89.7  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.16 
 
 		 807 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  19.53 
 
 		 1051 aa  85.9  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.02 
 
 		 808 aa  85.1  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  19.95 
 
 		 821 aa  84.7  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.27 
 
 		 815 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  22.07 
 
 		 764 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  21.48 
 
 		 767 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  23.05 
 
 		 772 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.47 
 
 		 967 aa  80.1  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  25.12 
 
 		 905 aa  80.5  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  23.6 
 
 		 828 aa  79  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  21.95 
 
 		 763 aa  77.8  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  25.46 
 
 		 380 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  32.26 
 
 		 792 aa  76.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  20.22 
 
 		 767 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  27.32 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  20.28 
 
 		 768 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  27.45 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  20.03 
 
 		 799 aa  74.7  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  27.18 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  26.59 
 
 		 898 aa  73.9  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  22.79 
 
 		 860 aa  73.9  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  19.21 
 
 		 778 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  19.52 
 
 		 808 aa  73.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  19.67 
 
 		 796 aa  72.4  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.05 
 
 		 747 aa  72  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  21.93 
 
 		 751 aa  72.4  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  21.1 
 
 		 791 aa  72  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.35 
 
 		 811 aa  72  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  20.58 
 
 		 881 aa  70.9  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  24.24 
 
 		 695 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  21.24 
 
 		 816 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  20.6 
 
 		 813 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  19.81 
 
 		 784 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  26.7 
 
 		 388 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  21.15 
 
 		 823 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  20.45 
 
 		 815 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  23.42 
 
 		 877 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.43 
 
 		 800 aa  68.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  20.84 
 
 		 771 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.99 
 
 		 773 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.03 
 
 		 807 aa  67.8  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  20.5 
 
 		 770 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  20.6 
 
 		 768 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  18.31 
 
 		 787 aa  67  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  20.69 
 
 		 823 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  21.2 
 
 		 865 aa  67  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  25.56 
 
 		 790 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  20.33 
 
 		 816 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.07 
 
 		 806 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  19.87 
 
 		 821 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  20.95 
 
 		 728 aa  65.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  22.31 
 
 		 792 aa  65.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  21.33 
 
 		 820 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.2 
 
 		 800 aa  65.1  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  24.28 
 
 		 779 aa  64.7  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  20.19 
 
 		 771 aa  63.9  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  20.76 
 
 		 823 aa  63.9  0.000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  21.6 
 
 		 834 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  20.16 
 
 		 797 aa  62.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.96 
 
 		 837 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  20.32 
 
 		 788 aa  61.6  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  21.68 
 
 		 865 aa  60.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  21.37 
 
 		 824 aa  60.8  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  26.09 
 
 		 797 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1909  hypothetical protein  23.36 
 
 		 692 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00515667  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  23.94 
 
 		 387 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  20.45 
 
 		 835 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  20.23 
 
 		 771 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  20.23 
 
 		 771 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  19.92 
 
 		 771 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.35 
 
 		 1226 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  23.7 
 
 		 874 aa  58.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1480  hypothetical protein  20.79 
 
 		 701 aa  57.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0156637  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  25.31 
 
 		 685 aa  57.8  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  19.95 
 
 		 804 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.37 
 
 		 1291 aa  57.4  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>