More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1194 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  45.94 
 
 		 842 aa  650    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  100 
 
 		 832 aa  1627    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  54.4 
 
 		 923 aa  807    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  43.43 
 
 		 805 aa  605  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  42.2 
 
 		 879 aa  538  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  31.72 
 
 		 895 aa  360  8e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  37.22 
 
 		 1204 aa  333  6e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  33.23 
 
 		 1131 aa  309  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  31.67 
 
 		 1011 aa  306  8.000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  31.81 
 
 		 862 aa  306  1.0000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  31.54 
 
 		 874 aa  298  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  30.59 
 
 		 862 aa  283  8.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  29.26 
 
 		 855 aa  283  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  33.08 
 
 		 1109 aa  283  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  26.94 
 
 		 1359 aa  258  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  29.69 
 
 		 872 aa  258  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  26.85 
 
 		 860 aa  190  9e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  24.55 
 
 		 864 aa  159  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.41 
 
 		 764 aa  144  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  24.96 
 
 		 748 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  25.67 
 
 		 388 aa  121  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  25.18 
 
 		 380 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.08 
 
 		 747 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.48 
 
 		 746 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  21.83 
 
 		 777 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  24.16 
 
 		 752 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  29.49 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  24.29 
 
 		 385 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  29.03 
 
 		 385 aa  104  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  25.31 
 
 		 752 aa  100  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  22.24 
 
 		 777 aa  96.3  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  19.38 
 
 		 767 aa  94.4  8e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.7 
 
 		 758 aa  93.6  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  27.65 
 
 		 387 aa  90.5  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  32.37 
 
 		 821 aa  89  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.57 
 
 		 808 aa  88.6  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  23.84 
 
 		 756 aa  88.2  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  24.58 
 
 		 755 aa  87.8  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  28.28 
 
 		 778 aa  87.8  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  25.37 
 
 		 1051 aa  87.4  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  23.1 
 
 		 812 aa  85.9  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.5 
 
 		 807 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  31.46 
 
 		 687 aa  85.1  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  33.33 
 
 		 889 aa  84.7  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  22.5 
 
 		 755 aa  84.3  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.81 
 
 		 967 aa  81.3  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  22.14 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  22.78 
 
 		 799 aa  78.2  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  20.2 
 
 		 727 aa  77.8  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  25.38 
 
 		 835 aa  77  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  32.93 
 
 		 1045 aa  75.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  26.39 
 
 		 815 aa  74.7  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  34.06 
 
 		 845 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  21.38 
 
 		 821 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  23.49 
 
 		 786 aa  72.8  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  25.96 
 
 		 807 aa  72.8  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  23.49 
 
 		 786 aa  72.8  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  25.84 
 
 		 898 aa  71.2  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  22.17 
 
 		 820 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.31 
 
 		 756 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.91 
 
 		 806 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  22.83 
 
 		 816 aa  67.8  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  30.41 
 
 		 899 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  24.44 
 
 		 825 aa  66.6  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  23.17 
 
 		 805 aa  66.6  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  23.17 
 
 		 805 aa  66.6  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  28.06 
 
 		 905 aa  65.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  30.3 
 
 		 695 aa  65.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  27.37 
 
 		 839 aa  65.1  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  35.06 
 
 		 893 aa  64.7  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  21.64 
 
 		 795 aa  64.7  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  18.72 
 
 		 788 aa  64.3  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  27.64 
 
 		 790 aa  63.9  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  22.26 
 
 		 847 aa  64.3  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  30.99 
 
 		 921 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  29.71 
 
 		 892 aa  63.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  22.45 
 
 		 813 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  27.23 
 
 		 972 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.78 
 
 		 773 aa  62.4  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  29.38 
 
 		 1128 aa  61.6  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  21.47 
 
 		 800 aa  61.6  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  33.1 
 
 		 815 aa  61.2  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  27.23 
 
 		 779 aa  61.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.59 
 
 		 789 aa  60.8  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  26.86 
 
 		 846 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  23.98 
 
 		 792 aa  60.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.65 
 
 		 883 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.85 
 
 		 883 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  30.52 
 
 		 786 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  30.52 
 
 		 786 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  30.52 
 
 		 786 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  28.65 
 
 		 920 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  28.64 
 
 		 737 aa  59.3  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  26.09 
 
 		 865 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  27.21 
 
 		 869 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  27.21 
 
 		 869 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  26.22 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.29 
 
 		 1291 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  25.28 
 
 		 769 aa  58.2  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1083 aa  58.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>