More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1519 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  43.12 
 
 		 825 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  42.14 
 
 		 835 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  100 
 
 		 859 aa  1741    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  41.76 
 
 		 872 aa  624  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  37.63 
 
 		 828 aa  569  1e-161  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  36.22 
 
 		 816 aa  552  1e-155  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  35.94 
 
 		 824 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  37.07 
 
 		 815 aa  538  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  36.74 
 
 		 821 aa  531  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  35.34 
 
 		 821 aa  514  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  33.7 
 
 		 813 aa  479  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  35.15 
 
 		 823 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  35.59 
 
 		 823 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  34.87 
 
 		 823 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  30.08 
 
 		 800 aa  402  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  29.56 
 
 		 807 aa  249  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.76 
 
 		 808 aa  152  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  22.48 
 
 		 788 aa  144  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.71 
 
 		 815 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  22.21 
 
 		 905 aa  137  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  20.85 
 
 		 788 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.63 
 
 		 773 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  19.84 
 
 		 764 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  22.51 
 
 		 767 aa  119  3e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.65 
 
 		 831 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  33.94 
 
 		 807 aa  109  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  26.69 
 
 		 1051 aa  106  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  32.86 
 
 		 755 aa  104  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  37.35 
 
 		 756 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  33.92 
 
 		 778 aa  101  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  34.25 
 
 		 801 aa  101  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  32.94 
 
 		 762 aa  99.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  21.72 
 
 		 881 aa  98.6  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  20.87 
 
 		 792 aa  96.3  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.98 
 
 		 800 aa  95.9  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  30.85 
 
 		 388 aa  94  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  26.9 
 
 		 385 aa  93.2  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  28.82 
 
 		 751 aa  93.2  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  33.57 
 
 		 806 aa  92.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  26.43 
 
 		 385 aa  91.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  29.09 
 
 		 789 aa  90.5  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  21.67 
 
 		 763 aa  90.1  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  30.99 
 
 		 898 aa  87.8  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  27.14 
 
 		 385 aa  87  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  30.52 
 
 		 1204 aa  86.3  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  29.09 
 
 		 879 aa  86.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  23.45 
 
 		 380 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  31.9 
 
 		 855 aa  86.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  26.96 
 
 		 778 aa  84.7  0.000000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  31.9 
 
 		 862 aa  84.3  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  29.36 
 
 		 967 aa  84.3  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  30.73 
 
 		 776 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  35.76 
 
 		 837 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  31.48 
 
 		 874 aa  80.9  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  32.52 
 
 		 842 aa  80.9  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1083 aa  80.1  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  29.08 
 
 		 1359 aa  80.5  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  21.84 
 
 		 797 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  29.41 
 
 		 895 aa  79.7  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  34.62 
 
 		 803 aa  78.2  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  20.83 
 
 		 789 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  28.33 
 
 		 860 aa  77  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  27.96 
 
 		 830 aa  76.3  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  28.22 
 
 		 1011 aa  76.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  30.54 
 
 		 811 aa  75.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  19.93 
 
 		 788 aa  75.5  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  27.43 
 
 		 865 aa  75.5  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  36 
 
 		 804 aa  74.3  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  28.9 
 
 		 692 aa  73.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  34.07 
 
 		 764 aa  74.3  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  28.12 
 
 		 1131 aa  73.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  19.61 
 
 		 788 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  32.52 
 
 		 779 aa  72.4  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.9 
 
 		 872 aa  71.6  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  25.87 
 
 		 727 aa  70.5  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  30.36 
 
 		 923 aa  70.1  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  25.45 
 
 		 864 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  25.45 
 
 		 1013 aa  69.3  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  20.97 
 
 		 789 aa  69.3  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  20.5 
 
 		 694 aa  68.9  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  29.26 
 
 		 1022 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  29.26 
 
 		 1022 aa  68.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  20.97 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  28.29 
 
 		 862 aa  68.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  24.07 
 
 		 748 aa  67.8  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  27.89 
 
 		 810 aa  67  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  26.7 
 
 		 779 aa  67.4  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  21.82 
 
 		 805 aa  67.4  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  27.8 
 
 		 1028 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  27.35 
 
 		 694 aa  66.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  30.81 
 
 		 832 aa  65.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  32.69 
 
 		 820 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  27.47 
 
 		 869 aa  65.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  31.61 
 
 		 785 aa  65.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  27.47 
 
 		 869 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  28.48 
 
 		 816 aa  65.1  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  27.8 
 
 		 1040 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  27.14 
 
 		 787 aa  64.7  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.74 
 
 		 812 aa  64.7  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  27.8 
 
 		 681 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>