More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2637 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  41.83 
 
 
1001 aa  676    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  65.22 
 
 
681 aa  698    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  40.08 
 
 
1146 aa  688    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  100 
 
 
1013 aa  1993    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  40.56 
 
 
998 aa  656    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  39.9 
 
 
1062 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  62.37 
 
 
1022 aa  1176    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  41.44 
 
 
1002 aa  701    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  40.56 
 
 
998 aa  656    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  39.9 
 
 
1062 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  62.37 
 
 
1022 aa  1176    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  40.22 
 
 
1000 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  62.54 
 
 
1028 aa  1152    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  59.94 
 
 
1003 aa  1119    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  40.56 
 
 
998 aa  656    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  40.99 
 
 
1077 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  62.45 
 
 
1040 aa  1149    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  39.45 
 
 
1089 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  32.5 
 
 
1011 aa  477  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  31.54 
 
 
967 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  56.15 
 
 
470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  31.2 
 
 
958 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  34.44 
 
 
1013 aa  438  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  30.75 
 
 
962 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  29.41 
 
 
941 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  30.22 
 
 
968 aa  426  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  29.72 
 
 
948 aa  426  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  30.15 
 
 
968 aa  422  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  29.37 
 
 
944 aa  422  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  29.61 
 
 
964 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  30.4 
 
 
959 aa  412  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  28.87 
 
 
1001 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  28.94 
 
 
968 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  28.94 
 
 
968 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  28.94 
 
 
968 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  29.82 
 
 
945 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  29.82 
 
 
945 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  29.86 
 
 
955 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  29.86 
 
 
955 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  29.86 
 
 
955 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  28.53 
 
 
968 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  29.31 
 
 
957 aa  382  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  28.61 
 
 
963 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  27.18 
 
 
968 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  28.46 
 
 
945 aa  335  3e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  26.1 
 
 
974 aa  277  7e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  25.31 
 
 
1054 aa  271  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  26.82 
 
 
1068 aa  268  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  23.98 
 
 
1040 aa  267  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  23.22 
 
 
1049 aa  249  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  21.23 
 
 
1109 aa  239  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  20.94 
 
 
1109 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  22.66 
 
 
1038 aa  229  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  23.93 
 
 
1041 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  23.55 
 
 
1038 aa  218  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  23.35 
 
 
1038 aa  218  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  23.55 
 
 
1041 aa  218  7e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  23.27 
 
 
1038 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  23.34 
 
 
1038 aa  211  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  24.7 
 
 
888 aa  204  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  39.54 
 
 
397 aa  182  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  21.48 
 
 
1026 aa  179  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  28.72 
 
 
974 aa  169  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  37.55 
 
 
981 aa  160  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  42.86 
 
 
750 aa  149  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  32.91 
 
 
713 aa  142  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  40.26 
 
 
713 aa  140  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  36.75 
 
 
712 aa  139  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  45.06 
 
 
702 aa  139  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  39.65 
 
 
709 aa  138  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  41.58 
 
 
702 aa  137  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  35.08 
 
 
882 aa  137  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  39.66 
 
 
576 aa  135  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  39.57 
 
 
764 aa  134  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  34.57 
 
 
747 aa  132  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  44.08 
 
 
679 aa  132  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  29.62 
 
 
726 aa  131  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  36.51 
 
 
674 aa  131  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  36.51 
 
 
674 aa  131  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  43.67 
 
 
699 aa  131  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  36.51 
 
 
674 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  45.27 
 
 
733 aa  130  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  27.78 
 
 
1246 aa  129  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  35.19 
 
 
743 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  34.78 
 
 
743 aa  128  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  34.78 
 
 
743 aa  128  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  34.78 
 
 
743 aa  128  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  34.78 
 
 
743 aa  128  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  34.35 
 
 
743 aa  127  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  34.78 
 
 
743 aa  127  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  40 
 
 
780 aa  127  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  32.48 
 
 
740 aa  127  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  42.41 
 
 
678 aa  127  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  37.66 
 
 
697 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  38.36 
 
 
730 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  36.78 
 
 
339 aa  126  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  44.74 
 
 
706 aa  126  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  34.2 
 
 
743 aa  126  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  44.44 
 
 
682 aa  125  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  34.65 
 
 
743 aa  125  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>