237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2553 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  55.26 
 
 		 855 aa  867    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  61.86 
 
 		 872 aa  947    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  60.05 
 
 		 862 aa  934    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  100 
 
 		 862 aa  1679    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  39.98 
 
 		 895 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  41.61 
 
 		 1011 aa  498  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  42.11 
 
 		 1204 aa  487  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  38.83 
 
 		 1131 aa  468  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  35.27 
 
 		 874 aa  432  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  38.16 
 
 		 1109 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  33.18 
 
 		 842 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  32.86 
 
 		 860 aa  324  4e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  31.57 
 
 		 805 aa  314  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  29.89 
 
 		 1359 aa  280  1e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  30.59 
 
 		 832 aa  279  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  28.93 
 
 		 923 aa  267  8e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  31.19 
 
 		 879 aa  262  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.43 
 
 		 764 aa  138  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  25.12 
 
 		 778 aa  110  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  27.86 
 
 		 388 aa  100  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  38.06 
 
 		 380 aa  100  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  25.72 
 
 		 385 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  28.74 
 
 		 385 aa  99.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  24.96 
 
 		 755 aa  97.4  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.42 
 
 		 756 aa  97.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  22.29 
 
 		 777 aa  96.3  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  24.76 
 
 		 385 aa  94.7  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  23.89 
 
 		 812 aa  91.7  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  22.04 
 
 		 777 aa  88.2  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.59 
 
 		 1051 aa  87.4  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  28.37 
 
 		 835 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.2 
 
 		 815 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.62 
 
 		 807 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  21.16 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.43 
 
 		 807 aa  77.8  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  33.86 
 
 		 864 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  28.1 
 
 		 747 aa  76.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  25.79 
 
 		 905 aa  75.5  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  26.7 
 
 		 849 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  27.64 
 
 		 748 aa  72.4  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  35.11 
 
 		 845 aa  72.4  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  25.68 
 
 		 687 aa  72  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  23.53 
 
 		 752 aa  70.1  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  20.71 
 
 		 898 aa  69.3  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.58 
 
 		 806 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  28.18 
 
 		 839 aa  67.4  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  26.06 
 
 		 825 aa  67.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1083 aa  67  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  28.89 
 
 		 755 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.94 
 
 		 837 aa  66.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  22.58 
 
 		 872 aa  65.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  25.47 
 
 		 746 aa  65.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  25.23 
 
 		 893 aa  65.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  22.58 
 
 		 815 aa  65.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  27.16 
 
 		 859 aa  65.1  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.89 
 
 		 798 aa  64.7  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  25.81 
 
 		 861 aa  64.3  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.69 
 
 		 883 aa  64.3  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  25.93 
 
 		 921 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  31.44 
 
 		 1128 aa  63.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  28.04 
 
 		 843 aa  62.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  25.66 
 
 		 865 aa  61.6  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  34.45 
 
 		 1274 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  28.02 
 
 		 920 aa  60.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  25.2 
 
 		 847 aa  60.1  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  19.45 
 
 		 778 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.49 
 
 		 886 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  30.43 
 
 		 865 aa  60.1  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  33.82 
 
 		 752 aa  59.3  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  20.65 
 
 		 821 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.78 
 
 		 883 aa  58.9  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.72 
 
 		 967 aa  58.9  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.64 
 
 		 758 aa  58.5  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  21.36 
 
 		 796 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  23.63 
 
 		 808 aa  58.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  22.78 
 
 		 800 aa  58.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  22.73 
 
 		 780 aa  57.8  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  18.78 
 
 		 767 aa  57.8  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  27.75 
 
 		 899 aa  57.4  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  20.7 
 
 		 784 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.04 
 
 		 1045 aa  57.4  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  24.77 
 
 		 821 aa  57.4  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.26 
 
 		 895 aa  57  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  20.4 
 
 		 796 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  24.68 
 
 		 816 aa  56.2  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  19.18 
 
 		 794 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  26.37 
 
 		 890 aa  57  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.83 
 
 		 882 aa  57  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  28.77 
 
 		 1022 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.87 
 
 		 1291 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  28.77 
 
 		 1022 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  32.12 
 
 		 1287 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  31.98 
 
 		 860 aa  55.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  22.54 
 
 		 778 aa  55.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  21.69 
 
 		 790 aa  55.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.53 
 
 		 773 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  28.08 
 
 		 800 aa  55.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.33 
 
 		 811 aa  55.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.14 
 
 		 864 aa  55.1  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  27.44 
 
 		 889 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>