156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2094 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  100 
 
 		 778 aa  1564    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  53.67 
 
 		 780 aa  768    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0898  putative inner membrane protein  37.3 
 
 		 768 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.188824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4577  hypothetical protein  34.78 
 
 		 773 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  33.33 
 
 		 802 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3894  hypothetical protein  31.69 
 
 		 748 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4605  Patched family protein  33.51 
 
 		 799 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  32.78 
 
 		 803 aa  369  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0316  hypothetical protein  33.96 
 
 		 804 aa  362  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3897  hypothetical protein  33.88 
 
 		 804 aa  360  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  31.62 
 
 		 802 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  34.29 
 
 		 813 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4809  hypothetical protein  33.29 
 
 		 772 aa  353  7e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  31.45 
 
 		 805 aa  352  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  33.37 
 
 		 835 aa  350  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3685  hypothetical protein  32.96 
 
 		 839 aa  349  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  33.9 
 
 		 840 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  33.82 
 
 		 843 aa  343  9e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3607  putative lipoprotein transmembrane  30.87 
 
 		 803 aa  340  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  31.12 
 
 		 806 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0341  hypothetical protein  33.17 
 
 		 839 aa  333  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0332  hypothetical protein  33.7 
 
 		 839 aa  333  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3520  hypothetical protein  31.17 
 
 		 841 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0343  hypothetical protein  34.15 
 
 		 802 aa  328  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4377  hypothetical protein  33.13 
 
 		 834 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2755  hypothetical protein  33.33 
 
 		 768 aa  299  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4770  putative lipoprotein transmembrane  30.5 
 
 		 802 aa  297  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3693  lipoprotein transmembrane  30.5 
 
 		 802 aa  297  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.432372  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3388  hypothetical protein  31.74 
 
 		 799 aa  291  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  35.43 
 
 		 847 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4386  lipoprotein transmembrane  30.53 
 
 		 786 aa  281  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127353  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3914  putative lipoprotein transmembrane  31.89 
 
 		 784 aa  278  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3882  hypothetical protein  31.92 
 
 		 772 aa  277  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5102  hypothetical protein  28.04 
 
 		 791 aa  266  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0430  hypothetical protein  28.83 
 
 		 777 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152141  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0429  hypothetical protein  27.96 
 
 		 791 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0121  hypothetical protein  28.4 
 
 		 763 aa  224  4.9999999999999996e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0432  hypothetical protein  24.03 
 
 		 759 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6094  MMPL family membrane protein  26.69 
 
 		 823 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125086  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  25.87 
 
 		 826 aa  165  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  25.95 
 
 		 828 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  25.95 
 
 		 829 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2674  hypothetical protein  24.87 
 
 		 802 aa  164  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22432  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  25.64 
 
 		 826 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1496  putative lipoprotein transmembrane  26.88 
 
 		 740 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0305  MMPL domain protein  26.82 
 
 		 810 aa  147  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  23.97 
 
 		 783 aa  145  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0317  MMPL domain protein  27.96 
 
 		 806 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0934252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0068  MMPL domain protein  27.41 
 
 		 804 aa  141  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03730  membrane protein involved in xanthomonadin export  26.94 
 
 		 807 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  27.75 
 
 		 782 aa  137  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0941  hypothetical protein  26.21 
 
 		 784 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0798  hypothetical protein  26.21 
 
 		 784 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  26.05 
 
 		 794 aa  135  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  27.24 
 
 		 788 aa  130  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  27.07 
 
 		 788 aa  127  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0919  hypothetical protein  26.89 
 
 		 791 aa  122  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  23.24 
 
 		 782 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1374  hypothetical protein  26.79 
 
 		 778 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292609 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.79 
 
 		 1172 aa  110  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.78 
 
 		 1226 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.68 
 
 		 1291 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1322  hypothetical protein  22.54 
 
 		 802 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0976  KWG  22.58 
 
 		 749 aa  105  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  21.94 
 
 		 1225 aa  102  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0429  hypothetical protein  27.42 
 
 		 827 aa  99  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3990  hypothetical protein  24.55 
 
 		 784 aa  89  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3929  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.78 
 
 		 812 aa  84.3  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0282  hypothetical protein  21.66 
 
 		 742 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  23.79 
 
 		 1287 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  21.62 
 
 		 792 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  20.3 
 
 		 1274 aa  75.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  24.28 
 
 		 1204 aa  71.2  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0221  RND efflux transporter  22.12 
 
 		 771 aa  65.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.822518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  21.75 
 
 		 849 aa  64.3  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  21.82 
 
 		 895 aa  64.3  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  34.19 
 
 		 889 aa  62.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  26.35 
 
 		 747 aa  58.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  29.45 
 
 		 847 aa  58.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2104  exporter-like protein  23.09 
 
 		 704 aa  57.8  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  26.29 
 
 		 380 aa  56.2  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  21.62 
 
 		 846 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  21.17 
 
 		 893 aa  55.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  34.48 
 
 		 767 aa  55.1  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  21.62 
 
 		 840 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  19.93 
 
 		 1128 aa  54.7  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  21.52 
 
 		 784 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  32.81 
 
 		 901 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  34.13 
 
 		 843 aa  53.9  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  24.6 
 
 		 862 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.15 
 
 		 882 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  21.49 
 
 		 840 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  25.97 
 
 		 839 aa  52  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  21.63 
 
 		 786 aa  51.2  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  24.81 
 
 		 972 aa  51.2  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  30.53 
 
 		 892 aa  51.2  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.53 
 
 		 882 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.53 
 
 		 887 aa  50.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  28.85 
 
 		 969 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  19.77 
 
 		 868 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>