221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1479 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  70.49 
 
 		 870 aa  1179    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  99.07 
 
 		 1079 aa  1745    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  58.46 
 
 		 877 aa  901    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  49.61 
 
 		 887 aa  775    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  100 
 
 		 969 aa  1916    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  82.21 
 
 		 877 aa  1269    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  97.38 
 
 		 877 aa  1546    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  50 
 
 		 868 aa  765    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  50.58 
 
 		 868 aa  805    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.82 
 
 		 882 aa  649    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.61 
 
 		 895 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  50.86 
 
 		 862 aa  786    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  71.53 
 
 		 871 aa  1164    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  51.27 
 
 		 868 aa  749    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  50.34 
 
 		 872 aa  779    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  59.52 
 
 		 908 aa  937    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  83.01 
 
 		 877 aa  1350    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  83.01 
 
 		 877 aa  1347    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  50.98 
 
 		 862 aa  820    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  71.76 
 
 		 871 aa  1180    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  81.98 
 
 		 877 aa  1335    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  83.01 
 
 		 877 aa  1350    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  47.73 
 
 		 887 aa  713    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  48.53 
 
 		 882 aa  693    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  99.07 
 
 		 1083 aa  1745    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  99.66 
 
 		 877 aa  1719    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  99.89 
 
 		 877 aa  1724    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  100 
 
 		 877 aa  1725    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  99.66 
 
 		 877 aa  1719    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  82.1 
 
 		 877 aa  1334    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  81.98 
 
 		 877 aa  1364    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.65 
 
 		 882 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.81 
 
 		 882 aa  668    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  44.22 
 
 		 882 aa  632  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  48.55 
 
 		 669 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.94 
 
 		 864 aa  485  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  33.02 
 
 		 901 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  35.68 
 
 		 889 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  38.63 
 
 		 858 aa  389  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  33.45 
 
 		 890 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  33.67 
 
 		 901 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.91 
 
 		 900 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  34.8 
 
 		 879 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  37.72 
 
 		 864 aa  372  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  31.86 
 
 		 884 aa  349  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  27.83 
 
 		 1128 aa  287  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  30.59 
 
 		 767 aa  276  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  26.93 
 
 		 892 aa  253  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.23 
 
 		 886 aa  251  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.4 
 
 		 883 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  28.73 
 
 		 899 aa  221  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  25.53 
 
 		 920 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.12 
 
 		 883 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  26.82 
 
 		 972 aa  204  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  27.75 
 
 		 910 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  28.84 
 
 		 893 aa  198  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  27.44 
 
 		 906 aa  131  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.5 
 
 		 1045 aa  125  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  25.04 
 
 		 849 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  35.81 
 
 		 845 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  24.83 
 
 		 847 aa  72  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  31.51 
 
 		 839 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  29.21 
 
 		 1013 aa  68.2  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  22.05 
 
 		 1287 aa  67.8  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.29 
 
 		 798 aa  67.4  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  27.47 
 
 		 824 aa  64.7  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.33 
 
 		 789 aa  63.9  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  32.73 
 
 		 1204 aa  63.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  26.59 
 
 		 1011 aa  62.4  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  33.33 
 
 		 1359 aa  62  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  26.86 
 
 		 802 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  27.98 
 
 		 805 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  37.37 
 
 		 782 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  32.07 
 
 		 730 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1695  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.03 
 
 		 782 aa  58.5  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  26.74 
 
 		 681 aa  58.9  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  27.27 
 
 		 981 aa  57.4  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  30.82 
 
 		 802 aa  57.4  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  26.74 
 
 		 1028 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  26.74 
 
 		 1040 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.95 
 
 		 1291 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  22.07 
 
 		 713 aa  56.2  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  25 
 
 		 783 aa  55.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  25.42 
 
 		 840 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  25.42 
 
 		 846 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  29.35 
 
 		 777 aa  55.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.94 
 
 		 1172 aa  55.8  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  25.36 
 
 		 974 aa  55.8  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.29 
 
 		 1226 aa  55.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  29.17 
 
 		 380 aa  55.5  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  25.07 
 
 		 840 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  29.05 
 
 		 803 aa  55.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  26.67 
 
 		 755 aa  55.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  20.23 
 
 		 1274 aa  55.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  27.01 
 
 		 843 aa  55.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  26.34 
 
 		 1022 aa  55.1  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  28.9 
 
 		 855 aa  55.1  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  26.34 
 
 		 1022 aa  55.1  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  28.65 
 
 		 753 aa  54.7  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.72 
 
 		 773 aa  54.7  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>