45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2104 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2104  exporter-like protein  100 
 
 		 704 aa  1410    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  22.92 
 
 		 805 aa  93.6  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  23.09 
 
 		 782 aa  88.2  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  21.31 
 
 		 843 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  22.81 
 
 		 840 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  22.83 
 
 		 847 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3685  hypothetical protein  25.74 
 
 		 839 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0332  hypothetical protein  26.47 
 
 		 839 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  22.71 
 
 		 835 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4377  hypothetical protein  25.37 
 
 		 834 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  21.86 
 
 		 802 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0341  hypothetical protein  25.37 
 
 		 839 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  26.95 
 
 		 813 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  21.04 
 
 		 802 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3388  hypothetical protein  24.84 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  22.13 
 
 		 803 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3693  lipoprotein transmembrane  22.49 
 
 		 802 aa  64.3  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.432372  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4770  putative lipoprotein transmembrane  22.49 
 
 		 802 aa  64.3  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  22.67 
 
 		 778 aa  62  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3607  putative lipoprotein transmembrane  22.02 
 
 		 803 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.31 
 
 		 1291 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3897  hypothetical protein  23.53 
 
 		 804 aa  58.9  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0343  hypothetical protein  20.83 
 
 		 802 aa  57.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3882  hypothetical protein  21.08 
 
 		 772 aa  57  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0316  hypothetical protein  24.76 
 
 		 804 aa  57.4  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4605  Patched family protein  23.56 
 
 		 799 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3520  hypothetical protein  24.76 
 
 		 841 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  23.9 
 
 		 782 aa  56.2  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1322  hypothetical protein  21.37 
 
 		 802 aa  55.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  21.04 
 
 		 1287 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  21.92 
 
 		 780 aa  54.7  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  22.64 
 
 		 783 aa  54.3  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  20.5 
 
 		 788 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  20.78 
 
 		 806 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0068  MMPL domain protein  22.25 
 
 		 804 aa  53.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  19.62 
 
 		 1225 aa  51.6  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  22.46 
 
 		 849 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.79 
 
 		 1226 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1496  putative lipoprotein transmembrane  23.38 
 
 		 740 aa  48.5  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3929  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  21.55 
 
 		 812 aa  48.9  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  21.83 
 
 		 1274 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  22.18 
 
 		 788 aa  47.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5102  hypothetical protein  23.16 
 
 		 791 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0898  putative inner membrane protein  21.68 
 
 		 768 aa  44.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.188824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  28.77 
 
 		 847 aa  44.3  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>