136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3929 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0919  hypothetical protein  52.39 
 
 		 791 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0941  hypothetical protein  47.69 
 
 		 784 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0429  hypothetical protein  62.05 
 
 		 827 aa  829    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  51.03 
 
 		 783 aa  734    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3929  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  100 
 
 		 812 aa  1589    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2750  hypothetical protein  57.42 
 
 		 773 aa  700    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.536126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6094  MMPL family membrane protein  60.42 
 
 		 823 aa  852    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125086  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0068  MMPL domain protein  48.37 
 
 		 804 aa  654    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  60.59 
 
 		 782 aa  823    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  60.36 
 
 		 828 aa  872    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  61.31 
 
 		 826 aa  877    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  60.36 
 
 		 829 aa  872    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1374  hypothetical protein  58.35 
 
 		 778 aa  774    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0317  MMPL domain protein  61.71 
 
 		 806 aa  885    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0934252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0305  MMPL domain protein  61.4 
 
 		 810 aa  883    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0798  hypothetical protein  47.69 
 
 		 784 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  61.22 
 
 		 826 aa  873    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3990  hypothetical protein  50.26 
 
 		 784 aa  612  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2674  hypothetical protein  44.76 
 
 		 802 aa  548  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1322  hypothetical protein  47.72 
 
 		 802 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03730  membrane protein involved in xanthomonadin export  36.2 
 
 		 807 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780979  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  35.12 
 
 		 788 aa  344  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  35.12 
 
 		 788 aa  343  9e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  35.38 
 
 		 794 aa  340  9e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  29.32 
 
 		 802 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  27.65 
 
 		 805 aa  151  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  29.09 
 
 		 802 aa  147  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3685  hypothetical protein  25.78 
 
 		 839 aa  147  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  28.76 
 
 		 806 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3693  lipoprotein transmembrane  28.29 
 
 		 802 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.432372  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4770  putative lipoprotein transmembrane  28.29 
 
 		 802 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0341  hypothetical protein  25.91 
 
 		 839 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  28.16 
 
 		 803 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4605  Patched family protein  25.19 
 
 		 799 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5102  hypothetical protein  27.35 
 
 		 791 aa  126  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0343  hypothetical protein  23.85 
 
 		 802 aa  125  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  26.59 
 
 		 835 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  27.24 
 
 		 813 aa  121  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0332  hypothetical protein  26.35 
 
 		 839 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  24.49 
 
 		 780 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  26.33 
 
 		 847 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  26.33 
 
 		 843 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3897  hypothetical protein  22.6 
 
 		 804 aa  118  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  25.95 
 
 		 840 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  26.53 
 
 		 778 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0429  hypothetical protein  27.54 
 
 		 791 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0316  hypothetical protein  24.06 
 
 		 804 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235423 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  18.05 
 
 		 1172 aa  109  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4377  hypothetical protein  23.84 
 
 		 834 aa  108  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  18.13 
 
 		 1226 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0898  putative inner membrane protein  26.42 
 
 		 768 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.188824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  21.23 
 
 		 1274 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0430  hypothetical protein  28.27 
 
 		 777 aa  103  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152141  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3607  putative lipoprotein transmembrane  32.41 
 
 		 803 aa  100  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3894  hypothetical protein  25.43 
 
 		 748 aa  98.6  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3882  hypothetical protein  25.86 
 
 		 772 aa  98.2  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4386  lipoprotein transmembrane  27.9 
 
 		 786 aa  91.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127353  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.83 
 
 		 1291 aa  90.9  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  20.31 
 
 		 1225 aa  90.5  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  24.3 
 
 		 782 aa  89.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0432  hypothetical protein  19.78 
 
 		 759 aa  84  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3914  putative lipoprotein transmembrane  28.39 
 
 		 784 aa  79.7  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0121  hypothetical protein  22.62 
 
 		 763 aa  78.2  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4809  hypothetical protein  25.8 
 
 		 772 aa  78.2  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4577  hypothetical protein  26.68 
 
 		 773 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  23.9 
 
 		 849 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22.75 
 
 		 868 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1496  putative lipoprotein transmembrane  31.97 
 
 		 740 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2755  hypothetical protein  27.53 
 
 		 768 aa  60.8  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.68 
 
 		 1045 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  26.17 
 
 		 893 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  25.45 
 
 		 1287 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  29.35 
 
 		 778 aa  55.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.31 
 
 		 882 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.47 
 
 		 883 aa  55.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  32.54 
 
 		 882 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.31 
 
 		 882 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  26.67 
 
 		 862 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.31 
 
 		 669 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.16 
 
 		 895 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  26.7 
 
 		 840 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  26.7 
 
 		 846 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  29.13 
 
 		 963 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.37 
 
 		 882 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  30.51 
 
 		 877 aa  51.6  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  24.32 
 
 		 868 aa  51.6  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  25.48 
 
 		 747 aa  51.2  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.27 
 
 		 886 aa  51.2  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  25.64 
 
 		 890 aa  51.2  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  22.71 
 
 		 792 aa  50.8  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  25.74 
 
 		 871 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  21.68 
 
 		 385 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  21.4 
 
 		 385 aa  50.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.51 
 
 		 877 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  29.66 
 
 		 877 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  30.51 
 
 		 877 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  29.66 
 
 		 877 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  26.81 
 
 		 959 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.81 
 
 		 877 aa  48.9  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3388  hypothetical protein  35.63 
 
 		 799 aa  48.9  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>