105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2674 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1322  hypothetical protein  61.81 
 
 		 802 aa  744    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2674  hypothetical protein  100 
 
 		 802 aa  1562    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22432  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  45.06 
 
 		 828 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  45.06 
 
 		 829 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  45.55 
 
 		 826 aa  595  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  45.67 
 
 		 826 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  43.93 
 
 		 783 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0317  MMPL domain protein  46.04 
 
 		 806 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0934252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6094  MMPL family membrane protein  44.75 
 
 		 823 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125086  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0305  MMPL domain protein  44.59 
 
 		 810 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0068  MMPL domain protein  43.9 
 
 		 804 aa  550  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  45.43 
 
 		 782 aa  545  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1374  hypothetical protein  44.7 
 
 		 778 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292609 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0941  hypothetical protein  39.97 
 
 		 784 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0798  hypothetical protein  39.97 
 
 		 784 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0429  hypothetical protein  44.3 
 
 		 827 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0919  hypothetical protein  44.03 
 
 		 791 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3990  hypothetical protein  43 
 
 		 784 aa  500  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2750  hypothetical protein  45.69 
 
 		 773 aa  492  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.536126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3929  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.46 
 
 		 812 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03730  membrane protein involved in xanthomonadin export  34.42 
 
 		 807 aa  339  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  32.91 
 
 		 794 aa  311  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  33.33 
 
 		 788 aa  300  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  33.2 
 
 		 788 aa  296  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  28.66 
 
 		 802 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4605  Patched family protein  23.35 
 
 		 799 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214828 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  27.57 
 
 		 806 aa  152  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  28.04 
 
 		 805 aa  150  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4377  hypothetical protein  24.59 
 
 		 834 aa  148  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3607  putative lipoprotein transmembrane  28.55 
 
 		 803 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  23.82 
 
 		 778 aa  147  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3685  hypothetical protein  23.52 
 
 		 839 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  25.24 
 
 		 780 aa  147  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  23.91 
 
 		 813 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5102  hypothetical protein  27.6 
 
 		 791 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0343  hypothetical protein  24.79 
 
 		 802 aa  144  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  27.29 
 
 		 802 aa  144  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3897  hypothetical protein  24.14 
 
 		 804 aa  140  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  28.8 
 
 		 803 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0316  hypothetical protein  24.36 
 
 		 804 aa  137  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0429  hypothetical protein  30.2 
 
 		 791 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0430  hypothetical protein  27.47 
 
 		 777 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152141  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0332  hypothetical protein  23.87 
 
 		 839 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0341  hypothetical protein  23.72 
 
 		 839 aa  131  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  23.53 
 
 		 835 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1496  putative lipoprotein transmembrane  29.24 
 
 		 740 aa  124  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  23.97 
 
 		 843 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  23.97 
 
 		 847 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  23.28 
 
 		 840 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0898  putative inner membrane protein  28.95 
 
 		 768 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.188824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3894  hypothetical protein  27 
 
 		 748 aa  119  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4770  putative lipoprotein transmembrane  27.34 
 
 		 802 aa  119  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3693  lipoprotein transmembrane  27.34 
 
 		 802 aa  119  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.432372  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3520  hypothetical protein  25.57 
 
 		 841 aa  117  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4386  lipoprotein transmembrane  27.31 
 
 		 786 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127353  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.49 
 
 		 1226 aa  111  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  19.32 
 
 		 1172 aa  107  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0121  hypothetical protein  22.26 
 
 		 763 aa  107  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3882  hypothetical protein  25.25 
 
 		 772 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4577  hypothetical protein  24.91 
 
 		 773 aa  105  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3914  putative lipoprotein transmembrane  27.82 
 
 		 784 aa  97.4  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0432  hypothetical protein  19.36 
 
 		 759 aa  95.5  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4809  hypothetical protein  28.64 
 
 		 772 aa  94  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  25.66 
 
 		 782 aa  91.7  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  21.69 
 
 		 1225 aa  88.6  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  22.4 
 
 		 1287 aa  88.2  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.78 
 
 		 1291 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3388  hypothetical protein  24.47 
 
 		 799 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  24.27 
 
 		 849 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  24.16 
 
 		 839 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  19.77 
 
 		 1274 aa  72  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2755  hypothetical protein  27.65 
 
 		 768 aa  69.3  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.46 
 
 		 669 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0976  KWG  24.7 
 
 		 749 aa  56.2  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.17 
 
 		 868 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.55 
 
 		 882 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  28.25 
 
 		 889 aa  53.5  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0282  hypothetical protein  21.49 
 
 		 742 aa  53.5  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  29.07 
 
 		 893 aa  52.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.43 
 
 		 887 aa  51.2  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22.13 
 
 		 864 aa  51.2  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  32.86 
 
 		 882 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  28.76 
 
 		 847 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  22.83 
 
 		 892 aa  49.7  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.17 
 
 		 1045 aa  49.3  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.21 
 
 		 882 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  23.6 
 
 		 890 aa  48.5  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.71 
 
 		 895 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  24.44 
 
 		 862 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  28.15 
 
 		 874 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1079 aa  46.6  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  29.6 
 
 		 969 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1083 aa  46.2  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  28 
 
 		 862 aa  47  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  27.62 
 
 		 905 aa  45.8  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  29.84 
 
 		 877 aa  45.8  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  29.84 
 
 		 877 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  29.84 
 
 		 877 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  29.84 
 
 		 877 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  29.84 
 
 		 877 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>