More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1642 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  59.52 
 
 		 899 aa  971    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  58.92 
 
 		 883 aa  957    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  61.9 
 
 		 886 aa  1049    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  59.03 
 
 		 883 aa  956    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  61.27 
 
 		 1128 aa  1028    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  59.5 
 
 		 920 aa  1015    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  100 
 
 		 892 aa  1800    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.01 
 
 		 1045 aa  372  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  30.07 
 
 		 890 aa  365  3e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  28.6 
 
 		 893 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  29.37 
 
 		 901 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  29.61 
 
 		 972 aa  326  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  28.56 
 
 		 910 aa  325  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  29.84 
 
 		 884 aa  325  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  29.12 
 
 		 889 aa  325  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  28.28 
 
 		 901 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  29.52 
 
 		 879 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.52 
 
 		 900 aa  289  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  28.52 
 
 		 862 aa  287  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  27.42 
 
 		 887 aa  280  7e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.31 
 
 		 887 aa  280  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  28.12 
 
 		 908 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.12 
 
 		 882 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  27.97 
 
 		 862 aa  269  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.02 
 
 		 864 aa  262  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.69 
 
 		 868 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.28 
 
 		 882 aa  257  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  27.05 
 
 		 872 aa  253  9.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.62 
 
 		 871 aa  249  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  27.28 
 
 		 871 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.37 
 
 		 882 aa  238  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.75 
 
 		 882 aa  238  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.96 
 
 		 895 aa  237  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  26.06 
 
 		 877 aa  237  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.6 
 
 		 870 aa  233  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.55 
 
 		 877 aa  233  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  25.81 
 
 		 767 aa  232  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  26.49 
 
 		 868 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26 
 
 		 882 aa  231  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  26.63 
 
 		 969 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  26.63 
 
 		 877 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  26.63 
 
 		 877 aa  225  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  26.63 
 
 		 877 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  26.63 
 
 		 877 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1079 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1083 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.62 
 
 		 877 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.19 
 
 		 877 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  26.75 
 
 		 877 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  27.16 
 
 		 877 aa  217  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  27.06 
 
 		 868 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  26.1 
 
 		 877 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  26.1 
 
 		 877 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  27.2 
 
 		 858 aa  212  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  27.41 
 
 		 864 aa  203  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  26.32 
 
 		 877 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.57 
 
 		 669 aa  196  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  27.93 
 
 		 906 aa  195  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  26.01 
 
 		 849 aa  135  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  24.81 
 
 		 846 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  24.66 
 
 		 840 aa  124  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  24.11 
 
 		 840 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  27.09 
 
 		 847 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1695  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.64 
 
 		 782 aa  104  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.67 
 
 		 798 aa  102  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  29.09 
 
 		 845 aa  100  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  27.35 
 
 		 845 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.78 
 
 		 1172 aa  90.9  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  18.88 
 
 		 1226 aa  84  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  26.47 
 
 		 385 aa  80.1  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  25.62 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  25.98 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.49 
 
 		 764 aa  77.8  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  25.37 
 
 		 385 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  26.07 
 
 		 905 aa  76.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  28.16 
 
 		 737 aa  77  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  29.28 
 
 		 1013 aa  76.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  32.32 
 
 		 923 aa  75.5  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  30.28 
 
 		 1359 aa  75.5  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  27.07 
 
 		 843 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  28.99 
 
 		 839 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  29.44 
 
 		 753 aa  73.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  19.44 
 
 		 1274 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  26.15 
 
 		 786 aa  72  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  26.21 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  25.69 
 
 		 786 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  25.84 
 
 		 967 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  27.57 
 
 		 826 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  25.69 
 
 		 786 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  26.81 
 
 		 1022 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  25.69 
 
 		 786 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  22.49 
 
 		 792 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  26.81 
 
 		 1022 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  26.97 
 
 		 1003 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  24.26 
 
 		 741 aa  68.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  18.2 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.75 
 
 		 766 aa  68.6  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  24.77 
 
 		 786 aa  68.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  21.13 
 
 		 861 aa  68.2  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  27.69 
 
 		 681 aa  68.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>