112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3897 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4377  hypothetical protein  53.22 
 
 		 834 aa  731    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0341  hypothetical protein  53.2 
 
 		 839 aa  737    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3685  hypothetical protein  53.8 
 
 		 839 aa  775    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0343  hypothetical protein  53.2 
 
 		 802 aa  747    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0332  hypothetical protein  53.2 
 
 		 839 aa  730    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  53.6 
 
 		 840 aa  760    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3520  hypothetical protein  53.64 
 
 		 841 aa  739    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  54.67 
 
 		 813 aa  775    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  53.82 
 
 		 835 aa  764    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0316  hypothetical protein  59.67 
 
 		 804 aa  892    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3897  hypothetical protein  100 
 
 		 804 aa  1620    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  52.8 
 
 		 843 aa  748    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4605  Patched family protein  59.54 
 
 		 799 aa  872    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  52.78 
 
 		 847 aa  749    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3388  hypothetical protein  49.87 
 
 		 799 aa  622  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  35.64 
 
 		 780 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  33.71 
 
 		 778 aa  351  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3894  hypothetical protein  31.33 
 
 		 748 aa  295  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0898  putative inner membrane protein  32.62 
 
 		 768 aa  295  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.188824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4577  hypothetical protein  30.55 
 
 		 773 aa  289  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  29.75 
 
 		 802 aa  278  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4809  hypothetical protein  30.9 
 
 		 772 aa  274  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3882  hypothetical protein  29.53 
 
 		 772 aa  273  8.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  29.62 
 
 		 803 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  28.1 
 
 		 805 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  29.39 
 
 		 806 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4386  lipoprotein transmembrane  30.31 
 
 		 786 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127353  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0430  hypothetical protein  30.89 
 
 		 777 aa  252  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152141  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3914  putative lipoprotein transmembrane  31.19 
 
 		 784 aa  251  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  28.64 
 
 		 802 aa  251  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4770  putative lipoprotein transmembrane  28.21 
 
 		 802 aa  249  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3693  lipoprotein transmembrane  28.21 
 
 		 802 aa  249  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.432372  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5102  hypothetical protein  30.27 
 
 		 791 aa  245  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3607  putative lipoprotein transmembrane  28.73 
 
 		 803 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0429  hypothetical protein  29.43 
 
 		 791 aa  237  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2755  hypothetical protein  29.82 
 
 		 768 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1496  putative lipoprotein transmembrane  27.55 
 
 		 740 aa  208  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0432  hypothetical protein  23.51 
 
 		 759 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0121  hypothetical protein  25.66 
 
 		 763 aa  172  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  25.37 
 
 		 794 aa  162  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2674  hypothetical protein  24.48 
 
 		 802 aa  150  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22432  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  25.03 
 
 		 788 aa  146  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  24.77 
 
 		 788 aa  144  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03730  membrane protein involved in xanthomonadin export  25.97 
 
 		 807 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  25.06 
 
 		 782 aa  134  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  23.37 
 
 		 783 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0068  MMPL domain protein  22.98 
 
 		 804 aa  124  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  23.49 
 
 		 828 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  23.24 
 
 		 826 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  23.49 
 
 		 829 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0941  hypothetical protein  23.72 
 
 		 784 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0798  hypothetical protein  23.72 
 
 		 784 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  23.57 
 
 		 826 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0976  KWG  23.64 
 
 		 749 aa  114  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.58 
 
 		 1226 aa  111  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6094  MMPL family membrane protein  23.76 
 
 		 823 aa  109  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125086  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1374  hypothetical protein  24.74 
 
 		 778 aa  107  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3990  hypothetical protein  25.31 
 
 		 784 aa  105  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0282  hypothetical protein  22.7 
 
 		 742 aa  100  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0919  hypothetical protein  22.98 
 
 		 791 aa  99  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1322  hypothetical protein  24.22 
 
 		 802 aa  97.8  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0305  MMPL domain protein  26.41 
 
 		 810 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0429  hypothetical protein  23.28 
 
 		 827 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0317  MMPL domain protein  24.82 
 
 		 806 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0934252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3929  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  24.04 
 
 		 812 aa  85.5  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2750  hypothetical protein  22.57 
 
 		 773 aa  85.1  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.536126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.84 
 
 		 1291 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  21.03 
 
 		 1274 aa  80.1  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  18.48 
 
 		 1225 aa  70.1  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.02 
 
 		 1172 aa  67  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  23.69 
 
 		 782 aa  64.7  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  26.46 
 
 		 972 aa  57.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  24.32 
 
 		 874 aa  57  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.59 
 
 		 1045 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  20.31 
 
 		 792 aa  55.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  23.76 
 
 		 884 aa  54.3  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  26.72 
 
 		 387 aa  52.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  27.45 
 
 		 1359 aa  52  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  25.26 
 
 		 893 aa  51.6  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2104  exporter-like protein  25.44 
 
 		 704 aa  51.2  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.58 
 
 		 882 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  25.5 
 
 		 910 aa  50.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  26.72 
 
 		 385 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0221  RND efflux transporter  21.17 
 
 		 771 aa  49.7  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.822518  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  23.84 
 
 		 388 aa  49.7  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.17 
 
 		 895 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  26.32 
 
 		 908 aa  49.3  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  25.95 
 
 		 385 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  25.95 
 
 		 385 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_002620  TC0733  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  28.57 
 
 		 1400 aa  48.9  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  22.83 
 
 		 839 aa  48.9  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.32 
 
 		 886 aa  48.5  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  30 
 
 		 1287 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  22.18 
 
 		 881 aa  48.1  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  26.48 
 
 		 810 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  25.17 
 
 		 380 aa  47.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.17 
 
 		 882 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  33.33 
 
 		 807 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.71 
 
 		 882 aa  46.6  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  23.33 
 
 		 1204 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>