More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2918 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  46.35 
 
 		 1131 aa  831    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  63.99 
 
 		 895 aa  882    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  39.38 
 
 		 1109 aa  667    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  100 
 
 		 1204 aa  2396    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  59.95 
 
 		 1011 aa  816    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  41.42 
 
 		 855 aa  509  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  41.19 
 
 		 862 aa  501  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  41.96 
 
 		 872 aa  503  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  42.2 
 
 		 862 aa  475  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  41.21 
 
 		 874 aa  474  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  41.32 
 
 		 842 aa  423  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  34.61 
 
 		 805 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  35.44 
 
 		 923 aa  353  1e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  34.1 
 
 		 1359 aa  337  1e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  34.58 
 
 		 879 aa  331  4e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  36.33 
 
 		 832 aa  331  4e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  34.14 
 
 		 860 aa  298  5e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  26.59 
 
 		 764 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  24.92 
 
 		 748 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  24.33 
 
 		 755 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  24.71 
 
 		 752 aa  136  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  24.29 
 
 		 747 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  25.25 
 
 		 778 aa  127  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.76 
 
 		 746 aa  124  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  24.84 
 
 		 752 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  24.32 
 
 		 864 aa  122  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  25 
 
 		 812 aa  122  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  25.06 
 
 		 380 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  23.76 
 
 		 385 aa  119  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  30.08 
 
 		 385 aa  118  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  29.96 
 
 		 385 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.83 
 
 		 807 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  22.91 
 
 		 777 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  28.02 
 
 		 388 aa  110  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  22.85 
 
 		 777 aa  110  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  23.08 
 
 		 1051 aa  106  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  30.63 
 
 		 835 aa  105  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.01 
 
 		 807 aa  102  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  23.5 
 
 		 877 aa  102  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  21.24 
 
 		 778 aa  98.2  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  23.6 
 
 		 756 aa  97.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  26.91 
 
 		 387 aa  94  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  28.9 
 
 		 825 aa  91.7  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  23.37 
 
 		 869 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1083 aa  89.4  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  24.96 
 
 		 821 aa  89  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  33.73 
 
 		 905 aa  89  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  22.99 
 
 		 789 aa  89  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  25.51 
 
 		 847 aa  89  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.24 
 
 		 815 aa  86.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  31.54 
 
 		 872 aa  85.9  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  21.85 
 
 		 788 aa  85.1  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  25.4 
 
 		 687 aa  83.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.2 
 
 		 808 aa  83.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.46 
 
 		 811 aa  83.2  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  27.98 
 
 		 816 aa  82  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  20.93 
 
 		 815 aa  82  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  29.73 
 
 		 859 aa  82  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  26.11 
 
 		 758 aa  81.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.91 
 
 		 806 aa  81.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  20.84 
 
 		 828 aa  80.1  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  27.62 
 
 		 865 aa  80.1  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  27.68 
 
 		 756 aa  80.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  21.75 
 
 		 821 aa  79  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  30.08 
 
 		 755 aa  77.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  22.96 
 
 		 800 aa  77.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  26.31 
 
 		 849 aa  76.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.63 
 
 		 773 aa  75.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  26.42 
 
 		 821 aa  76.3  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  21.19 
 
 		 824 aa  75.9  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.46 
 
 		 882 aa  75.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.26 
 
 		 831 aa  74.7  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  21.41 
 
 		 792 aa  74.7  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  27.91 
 
 		 804 aa  74.7  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  27.03 
 
 		 860 aa  74.3  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  27.43 
 
 		 861 aa  73.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.03 
 
 		 800 aa  73.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  30.4 
 
 		 921 aa  73.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.03 
 
 		 1291 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.56 
 
 		 788 aa  72.4  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  29.67 
 
 		 839 aa  71.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  34.15 
 
 		 890 aa  70.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  21.84 
 
 		 779 aa  70.1  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.1 
 
 		 801 aa  69.7  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  34.17 
 
 		 845 aa  69.7  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.31 
 
 		 1226 aa  69.7  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  29.14 
 
 		 865 aa  69.3  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  24.93 
 
 		 869 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  28.35 
 
 		 837 aa  67.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  30.07 
 
 		 898 aa  67  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.85 
 
 		 798 aa  65.1  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  29.26 
 
 		 901 aa  64.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  28.24 
 
 		 792 aa  63.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  21.16 
 
 		 799 aa  63.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  33.59 
 
 		 889 aa  63.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  23.14 
 
 		 881 aa  63.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  28.74 
 
 		 1013 aa  63.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  31.58 
 
 		 699 aa  63.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  25 
 
 		 767 aa  63.5  0.00000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  28.91 
 
 		 972 aa  63.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>