More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2739 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  100 
 
 		 845 aa  1687    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  29.32 
 
 		 840 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  28.57 
 
 		 846 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  28.45 
 
 		 840 aa  190  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  27.07 
 
 		 845 aa  177  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.43 
 
 		 883 aa  151  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  25.74 
 
 		 890 aa  140  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  24.39 
 
 		 847 aa  135  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.22 
 
 		 886 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  25.98 
 
 		 862 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  26.95 
 
 		 893 aa  126  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  25.62 
 
 		 877 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  30.45 
 
 		 920 aa  119  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  21.85 
 
 		 1359 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.66 
 
 		 871 aa  118  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  22.99 
 
 		 380 aa  117  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.35 
 
 		 870 aa  114  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  23.42 
 
 		 385 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  23.02 
 
 		 385 aa  112  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  25.93 
 
 		 887 aa  109  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  22.75 
 
 		 385 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  25.29 
 
 		 889 aa  108  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.18 
 
 		 883 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.51 
 
 		 868 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.38 
 
 		 1045 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  26.19 
 
 		 862 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  25.68 
 
 		 872 aa  101  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22.47 
 
 		 864 aa  100  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  29.09 
 
 		 892 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  30.14 
 
 		 388 aa  99  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1695  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.41 
 
 		 782 aa  99.4  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  31.82 
 
 		 1128 aa  98.6  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  29.88 
 
 		 899 aa  98.2  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  37.04 
 
 		 843 aa  94.7  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  23.96 
 
 		 972 aa  90.5  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  32.39 
 
 		 906 aa  89.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  25.23 
 
 		 874 aa  89  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  39.53 
 
 		 901 aa  88.6  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  36.99 
 
 		 849 aa  88.2  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  23.11 
 
 		 387 aa  87.8  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  30.54 
 
 		 901 aa  83.6  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  21.84 
 
 		 1287 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  28.7 
 
 		 910 aa  83.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.06 
 
 		 887 aa  81.3  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  35.81 
 
 		 1079 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.95 
 
 		 895 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  35.81 
 
 		 969 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.79 
 
 		 756 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  35.81 
 
 		 877 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  35.81 
 
 		 877 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  35.81 
 
 		 877 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  35.81 
 
 		 1083 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  35.81 
 
 		 877 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  35.81 
 
 		 877 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  36.64 
 
 		 839 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  23.22 
 
 		 862 aa  79  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.51 
 
 		 882 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.07 
 
 		 882 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.02 
 
 		 669 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  26.76 
 
 		 884 aa  78.2  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  24.96 
 
 		 895 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.87 
 
 		 882 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  18.7 
 
 		 1291 aa  75.1  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  21.45 
 
 		 864 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  37.17 
 
 		 782 aa  74.7  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  34.65 
 
 		 767 aa  74.7  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  35.66 
 
 		 879 aa  74.3  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  34.06 
 
 		 832 aa  74.3  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  25.62 
 
 		 868 aa  73.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  29.52 
 
 		 871 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  19.58 
 
 		 1274 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.84 
 
 		 1226 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  36 
 
 		 872 aa  73.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  27.8 
 
 		 861 aa  73.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.57 
 
 		 877 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  35.57 
 
 		 877 aa  72  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  23.85 
 
 		 778 aa  71.6  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  20.89 
 
 		 694 aa  71.6  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.67 
 
 		 882 aa  71.2  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.23 
 
 		 877 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  29.35 
 
 		 764 aa  70.9  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  36.72 
 
 		 855 aa  70.5  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  31.39 
 
 		 792 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  34.23 
 
 		 877 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.11 
 
 		 747 aa  70.1  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  32.73 
 
 		 877 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.23 
 
 		 877 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  32.73 
 
 		 877 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  24.71 
 
 		 835 aa  69.3  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  32.28 
 
 		 812 aa  68.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  33.85 
 
 		 923 aa  68.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  31.39 
 
 		 1131 aa  67.4  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  30.33 
 
 		 905 aa  66.6  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  20.56 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  27.56 
 
 		 758 aa  66.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  30.71 
 
 		 748 aa  65.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  30.11 
 
 		 842 aa  65.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  30.66 
 
 		 1011 aa  64.7  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0221  RND efflux transporter  33.06 
 
 		 771 aa  64.3  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.822518  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  19.81 
 
 		 799 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>