More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1056 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  48.64 
 
 		 746 aa  701    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  47.83 
 
 		 747 aa  729    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  48.34 
 
 		 758 aa  732    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  41.14 
 
 		 752 aa  638    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  100 
 
 		 756 aa  1527    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  51.29 
 
 		 752 aa  782    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  48.86 
 
 		 777 aa  719    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  46.18 
 
 		 777 aa  685    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  34.73 
 
 		 748 aa  466  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  34.33 
 
 		 812 aa  432  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  33.87 
 
 		 778 aa  422  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  32.7 
 
 		 755 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  31.68 
 
 		 864 aa  298  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  27.83 
 
 		 821 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  25.28 
 
 		 687 aa  209  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  29.03 
 
 		 889 aa  207  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  24.65 
 
 		 865 aa  198  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.68 
 
 		 764 aa  142  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  25.8 
 
 		 921 aa  137  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  28.01 
 
 		 385 aa  127  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  26.51 
 
 		 385 aa  126  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  26.3 
 
 		 388 aa  124  9e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  28.49 
 
 		 385 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  24.64 
 
 		 895 aa  120  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.41 
 
 		 1051 aa  116  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  22.53 
 
 		 1011 aa  112  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  23.69 
 
 		 805 aa  112  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  26.38 
 
 		 387 aa  112  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  23.12 
 
 		 380 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  23.09 
 
 		 1359 aa  103  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  22.17 
 
 		 842 aa  102  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.24 
 
 		 807 aa  92.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  19.63 
 
 		 778 aa  91.7  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  20.41 
 
 		 788 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  19.82 
 
 		 755 aa  90.1  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  20.55 
 
 		 816 aa  84.3  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  22.58 
 
 		 862 aa  84.3  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  19.46 
 
 		 779 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  27.57 
 
 		 831 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  19.22 
 
 		 815 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  20.93 
 
 		 807 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.82 
 
 		 811 aa  79  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  20.53 
 
 		 801 aa  76.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1083 aa  77.4  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  36.21 
 
 		 874 aa  75.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  24.86 
 
 		 1022 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  24.86 
 
 		 1022 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  23.59 
 
 		 832 aa  72.4  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.99 
 
 		 1109 aa  72  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  18.99 
 
 		 786 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  27.54 
 
 		 1204 aa  71.2  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  19.54 
 
 		 767 aa  71.2  0.00000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  19.42 
 
 		 773 aa  70.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  23.72 
 
 		 974 aa  70.1  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  23.78 
 
 		 681 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  24.14 
 
 		 972 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  18.66 
 
 		 788 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  29.61 
 
 		 923 aa  68.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  21.96 
 
 		 717 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  19.84 
 
 		 756 aa  69.3  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  30.14 
 
 		 1131 aa  68.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  23.24 
 
 		 1040 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  19.44 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  24.14 
 
 		 1028 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  24.21 
 
 		 825 aa  68.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.77 
 
 		 717 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  29.78 
 
 		 893 aa  67  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  21.65 
 
 		 974 aa  66.6  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  18.82 
 
 		 786 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  24.92 
 
 		 814 aa  67  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  21.48 
 
 		 821 aa  67  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  22.15 
 
 		 709 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  18.82 
 
 		 786 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  18.48 
 
 		 789 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  17.8 
 
 		 785 aa  67  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  22.67 
 
 		 734 aa  67  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  20.74 
 
 		 787 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  26.22 
 
 		 861 aa  66.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.85 
 
 		 804 aa  65.9  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  24.11 
 
 		 713 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  22.58 
 
 		 753 aa  65.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  31 
 
 		 910 aa  65.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  25.25 
 
 		 1013 aa  65.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  24.23 
 
 		 968 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  20.72 
 
 		 741 aa  65.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  23.44 
 
 		 981 aa  65.1  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  23.38 
 
 		 835 aa  65.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  23.4 
 
 		 738 aa  65.1  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  18.41 
 
 		 788 aa  65.1  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  31.15 
 
 		 845 aa  64.7  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  21.57 
 
 		 784 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  19.2 
 
 		 821 aa  64.7  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  25.26 
 
 		 727 aa  64.7  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  26.54 
 
 		 962 aa  64.3  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  20.8 
 
 		 789 aa  63.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  25.36 
 
 		 1011 aa  63.9  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  18.8 
 
 		 789 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  22.68 
 
 		 695 aa  63.9  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  19.82 
 
 		 764 aa  63.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  20.47 
 
 		 779 aa  63.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>