219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0788 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  54.76 
 
 		 832 aa  806    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  100 
 
 		 923 aa  1817    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  42.96 
 
 		 805 aa  590  1e-167  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  44.57 
 
 		 842 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  42.61 
 
 		 879 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  32.83 
 
 		 895 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  35.44 
 
 		 1204 aa  335  2e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  30.82 
 
 		 862 aa  307  6e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  32.54 
 
 		 1011 aa  298  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  28.83 
 
 		 855 aa  297  5e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  30.1 
 
 		 1131 aa  290  8e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  31.7 
 
 		 874 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  29.99 
 
 		 872 aa  269  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.87 
 
 		 1109 aa  263  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  29.13 
 
 		 862 aa  258  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  28.27 
 
 		 1359 aa  219  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  29.16 
 
 		 860 aa  208  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.8 
 
 		 764 aa  145  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  22.89 
 
 		 864 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  22.13 
 
 		 748 aa  127  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.55 
 
 		 746 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  24.66 
 
 		 752 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.4 
 
 		 767 aa  113  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  24.22 
 
 		 752 aa  106  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  23.95 
 
 		 777 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  24.06 
 
 		 777 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.14 
 
 		 812 aa  102  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.2 
 
 		 756 aa  102  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  25.65 
 
 		 687 aa  100  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  23.63 
 
 		 758 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  25.77 
 
 		 865 aa  98.6  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  21.82 
 
 		 755 aa  97.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  33.77 
 
 		 388 aa  94  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  31.72 
 
 		 385 aa  90.9  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  30.94 
 
 		 385 aa  90.9  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  31.18 
 
 		 385 aa  89.7  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  30.32 
 
 		 380 aa  87.8  8e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  23.56 
 
 		 815 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  26.21 
 
 		 747 aa  87  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.01 
 
 		 808 aa  82.4  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  25.25 
 
 		 755 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  25.74 
 
 		 778 aa  78.6  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  26.29 
 
 		 835 aa  75.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  25.61 
 
 		 898 aa  75.5  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  31.1 
 
 		 899 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  28.79 
 
 		 821 aa  74.7  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.06 
 
 		 807 aa  73.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  25.52 
 
 		 387 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  24.29 
 
 		 893 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  32.32 
 
 		 892 aa  73.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.95 
 
 		 806 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.57 
 
 		 1045 aa  71.2  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  20.26 
 
 		 816 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  28.5 
 
 		 905 aa  70.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  32.04 
 
 		 1128 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  35.11 
 
 		 889 aa  70.5  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.95 
 
 		 778 aa  70.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.71 
 
 		 883 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.1 
 
 		 883 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.08 
 
 		 773 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  30.49 
 
 		 920 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  25.1 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  30.11 
 
 		 821 aa  67.8  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  29.14 
 
 		 807 aa  67.4  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  33.85 
 
 		 845 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  26.7 
 
 		 825 aa  66.6  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  31.3 
 
 		 830 aa  65.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  27.49 
 
 		 684 aa  65.1  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  28.22 
 
 		 695 aa  63.9  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  24.53 
 
 		 756 aa  63.9  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  30.57 
 
 		 859 aa  63.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  24.14 
 
 		 791 aa  63.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  22.49 
 
 		 847 aa  62.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  25.71 
 
 		 800 aa  62.4  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  28.76 
 
 		 811 aa  62.4  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  31.16 
 
 		 729 aa  62  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.83 
 
 		 837 aa  62  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  25 
 
 		 821 aa  61.6  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  24.68 
 
 		 849 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  30.48 
 
 		 805 aa  60.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  30.48 
 
 		 805 aa  60.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.07 
 
 		 1226 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  27.17 
 
 		 816 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  26.07 
 
 		 901 aa  60.1  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  24.52 
 
 		 799 aa  60.1  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  20.42 
 
 		 792 aa  60.1  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  21.53 
 
 		 758 aa  59.3  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  20.99 
 
 		 727 aa  59.3  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.32 
 
 		 801 aa  58.9  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.21 
 
 		 895 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  29.03 
 
 		 813 aa  58.2  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1083 aa  57.4  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.21 
 
 		 882 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  32.14 
 
 		 882 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  28.83 
 
 		 839 aa  57.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  27.53 
 
 		 972 aa  57.4  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.93 
 
 		 882 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  21.94 
 
 		 796 aa  56.6  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  26.57 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  31.21 
 
 		 669 aa  57  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>