More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0392 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  100 
 
 		 837 aa  1679    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  46.51 
 
 		 815 aa  715    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.97 
 
 		 807 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  28.12 
 
 		 811 aa  286  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  26.55 
 
 		 800 aa  267  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  25.95 
 
 		 755 aa  266  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  25.12 
 
 		 789 aa  263  6.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.97 
 
 		 764 aa  258  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  26.88 
 
 		 792 aa  253  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  25.55 
 
 		 764 aa  247  8e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  24.97 
 
 		 801 aa  238  5.0000000000000005e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  25.35 
 
 		 779 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  23.94 
 
 		 778 aa  231  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.04 
 
 		 808 aa  230  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  26.89 
 
 		 756 aa  218  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.6 
 
 		 806 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  23.41 
 
 		 831 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  24.84 
 
 		 821 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  23.2 
 
 		 773 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  24.43 
 
 		 823 aa  191  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  26.34 
 
 		 751 aa  190  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  24.55 
 
 		 823 aa  187  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  24.67 
 
 		 823 aa  187  8e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.14 
 
 		 788 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  23.75 
 
 		 1051 aa  182  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  25.31 
 
 		 905 aa  181  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  24.16 
 
 		 765 aa  175  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1083 aa  170  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  21.59 
 
 		 804 aa  163  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  23.09 
 
 		 835 aa  163  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  20.85 
 
 		 821 aa  160  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  21.94 
 
 		 828 aa  156  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.9 
 
 		 807 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.46 
 
 		 800 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.74 
 
 		 816 aa  153  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.96 
 
 		 803 aa  152  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  21.14 
 
 		 824 aa  151  4e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  24.5 
 
 		 872 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  25.94 
 
 		 881 aa  147  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  21.44 
 
 		 825 aa  145  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  23.3 
 
 		 796 aa  144  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  20.92 
 
 		 813 aa  140  7.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  26.02 
 
 		 877 aa  140  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  24.1 
 
 		 792 aa  140  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  25.38 
 
 		 763 aa  138  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.68 
 
 		 967 aa  136  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20.81 
 
 		 869 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  20.81 
 
 		 869 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  22.56 
 
 		 808 aa  131  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  22.13 
 
 		 788 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  22.13 
 
 		 788 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  22.84 
 
 		 779 aa  127  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  22.64 
 
 		 789 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.17 
 
 		 815 aa  125  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.02 
 
 		 898 aa  124  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  27.98 
 
 		 860 aa  123  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  22.64 
 
 		 789 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  18.89 
 
 		 767 aa  120  9e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  22.32 
 
 		 797 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.88 
 
 		 762 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  25.31 
 
 		 697 aa  113  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  22.04 
 
 		 797 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  26.21 
 
 		 385 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  21.59 
 
 		 788 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  25.58 
 
 		 865 aa  108  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  21.72 
 
 		 861 aa  107  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  21.98 
 
 		 785 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  25.73 
 
 		 385 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  22.21 
 
 		 797 aa  102  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  21.4 
 
 		 799 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  21.12 
 
 		 830 aa  100  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  24.94 
 
 		 385 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.96 
 
 		 776 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  23.21 
 
 		 1011 aa  99.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  22.13 
 
 		 791 aa  97.4  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  21.45 
 
 		 790 aa  94  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  20.45 
 
 		 796 aa  94  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  20.93 
 
 		 805 aa  93.6  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  20.93 
 
 		 806 aa  92.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.52 
 
 		 747 aa  92.4  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  21.9 
 
 		 692 aa  90.9  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  21.47 
 
 		 787 aa  88.6  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.81 
 
 		 717 aa  87.4  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  30.11 
 
 		 388 aa  87.4  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  23.14 
 
 		 694 aa  85.1  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  20.84 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  21.67 
 
 		 772 aa  83.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  34.67 
 
 		 859 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  20.59 
 
 		 805 aa  83.2  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  20.59 
 
 		 805 aa  83.2  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  22.74 
 
 		 694 aa  82.8  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  19.55 
 
 		 748 aa  82  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0528  RND superfamily transporter  23.77 
 
 		 789 aa  80.9  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  20.78 
 
 		 727 aa  80.5  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  21.29 
 
 		 752 aa  79.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  23.3 
 
 		 923 aa  78.2  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  22.81 
 
 		 387 aa  77.4  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  22.47 
 
 		 874 aa  73.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  21.12 
 
 		 784 aa  73.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  21.92 
 
 		 901 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>