277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003709 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  52.67 
 
 		 779 aa  798    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  42.76 
 
 		 800 aa  640    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  100 
 
 		 792 aa  1617    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  45.66 
 
 		 764 aa  674    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  41.93 
 
 		 811 aa  592  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  31.47 
 
 		 765 aa  425  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  26.74 
 
 		 778 aa  278  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  27.35 
 
 		 755 aa  248  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.42 
 
 		 837 aa  237  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.46 
 
 		 807 aa  229  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  26.18 
 
 		 815 aa  220  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.06 
 
 		 717 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.15 
 
 		 764 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  23.86 
 
 		 756 aa  183  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.5 
 
 		 723 aa  179  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  22.97 
 
 		 789 aa  179  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  24.53 
 
 		 763 aa  167  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  25.99 
 
 		 751 aa  159  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1083 aa  154  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  22.07 
 
 		 801 aa  150  7e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  23.82 
 
 		 779 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.63 
 
 		 788 aa  147  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.77 
 
 		 773 aa  146  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  20.92 
 
 		 1051 aa  146  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.77 
 
 		 807 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.87 
 
 		 808 aa  140  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  22.88 
 
 		 803 aa  137  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.49 
 
 		 831 aa  136  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  22.22 
 
 		 869 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.47 
 
 		 806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  22.38 
 
 		 869 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  21.82 
 
 		 881 aa  129  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  20.59 
 
 		 825 aa  128  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.08 
 
 		 967 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  23.07 
 
 		 788 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  23.29 
 
 		 804 aa  124  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  19.9 
 
 		 767 aa  123  9.999999999999999e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  20.56 
 
 		 828 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  22.41 
 
 		 727 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  23.21 
 
 		 785 aa  122  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  20.81 
 
 		 872 aa  121  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  21.88 
 
 		 788 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  22.17 
 
 		 767 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  21.23 
 
 		 813 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  20.44 
 
 		 799 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  27.5 
 
 		 877 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  22.09 
 
 		 789 aa  111  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  22.28 
 
 		 772 aa  111  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  22.35 
 
 		 815 aa  110  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  21.48 
 
 		 771 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  20.85 
 
 		 816 aa  109  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  21.49 
 
 		 771 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  21.49 
 
 		 771 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  19.18 
 
 		 824 aa  108  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  21.34 
 
 		 768 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  19.23 
 
 		 835 aa  107  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  22.13 
 
 		 771 aa  107  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.99 
 
 		 762 aa  105  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  20.39 
 
 		 808 aa  105  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  24.42 
 
 		 789 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  19.42 
 
 		 821 aa  104  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  20.24 
 
 		 784 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  22.51 
 
 		 796 aa  102  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  19.23 
 
 		 821 aa  100  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  19.61 
 
 		 792 aa  100  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  22.87 
 
 		 800 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  21.4 
 
 		 767 aa  99.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  22.96 
 
 		 797 aa  98.6  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  21 
 
 		 786 aa  98.2  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  21.02 
 
 		 770 aa  98.2  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  20.86 
 
 		 771 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  19.62 
 
 		 796 aa  96.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  20.86 
 
 		 771 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  20.86 
 
 		 771 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  20.47 
 
 		 768 aa  96.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  21.2 
 
 		 769 aa  95.9  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  21.31 
 
 		 786 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  21.31 
 
 		 786 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  20.8 
 
 		 783 aa  94.7  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  20.85 
 
 		 771 aa  94.7  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  21.11 
 
 		 786 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  21.97 
 
 		 823 aa  93.2  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  22.41 
 
 		 823 aa  92.8  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  20.98 
 
 		 786 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  20.98 
 
 		 786 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  22.35 
 
 		 823 aa  92.8  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  20.25 
 
 		 790 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  20.72 
 
 		 771 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  24.21 
 
 		 860 aa  91.3  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  19.5 
 
 		 793 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  19.75 
 
 		 787 aa  91.3  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  19.64 
 
 		 790 aa  90.9  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  20 
 
 		 905 aa  90.5  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  20.83 
 
 		 786 aa  90.1  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  21.93 
 
 		 797 aa  89.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  19.72 
 
 		 692 aa  88.6  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  22.09 
 
 		 795 aa  88.2  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  28.57 
 
 		 898 aa  87.8  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  17.45 
 
 		 797 aa  87.4  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.89 
 
 		 1359 aa  87.4  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>