More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0689 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  100 
 
 		 899 aa  1786    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  64.6 
 
 		 920 aa  1110    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  78.31 
 
 		 1128 aa  1348    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  59.52 
 
 		 892 aa  1014    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  65.17 
 
 		 883 aa  1064    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  55.62 
 
 		 886 aa  902    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  64.95 
 
 		 883 aa  1068    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  31.26 
 
 		 901 aa  340  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  29.45 
 
 		 901 aa  336  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  31.52 
 
 		 972 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  28.36 
 
 		 890 aa  335  3e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.64 
 
 		 1045 aa  328  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  30.55 
 
 		 910 aa  328  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  29.25 
 
 		 893 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  30.56 
 
 		 889 aa  314  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  29.82 
 
 		 884 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.09 
 
 		 887 aa  295  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  28.23 
 
 		 862 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.27 
 
 		 882 aa  280  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.86 
 
 		 882 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  30.56 
 
 		 908 aa  269  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.51 
 
 		 900 aa  267  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  28.51 
 
 		 879 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.59 
 
 		 895 aa  266  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.28 
 
 		 868 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.24 
 
 		 882 aa  264  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  28.23 
 
 		 887 aa  262  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.73 
 
 		 882 aa  256  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.86 
 
 		 882 aa  255  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.88 
 
 		 871 aa  253  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  27.35 
 
 		 862 aa  251  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  27.6 
 
 		 767 aa  249  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  28.64 
 
 		 871 aa  249  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  28.72 
 
 		 872 aa  249  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.26 
 
 		 870 aa  244  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  28.6 
 
 		 877 aa  232  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.08 
 
 		 864 aa  232  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  26.82 
 
 		 868 aa  230  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  28.41 
 
 		 969 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  28 
 
 		 877 aa  228  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  27.78 
 
 		 877 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.77 
 
 		 877 aa  227  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  27.89 
 
 		 877 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  27.84 
 
 		 877 aa  225  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  27.84 
 
 		 877 aa  225  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1079 aa  225  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1083 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.74 
 
 		 669 aa  224  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  28.42 
 
 		 877 aa  224  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  28.21 
 
 		 877 aa  221  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  28.21 
 
 		 877 aa  221  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.09 
 
 		 877 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.37 
 
 		 877 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  27.69 
 
 		 868 aa  206  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  26.91 
 
 		 858 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  27.2 
 
 		 906 aa  194  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  27.96 
 
 		 864 aa  189  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  27.54 
 
 		 846 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  27.54 
 
 		 840 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  27.25 
 
 		 840 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1695  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.33 
 
 		 782 aa  116  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  29.83 
 
 		 764 aa  107  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.52 
 
 		 798 aa  107  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  24.56 
 
 		 845 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  29.13 
 
 		 877 aa  99  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  29.88 
 
 		 845 aa  97.8  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  30.95 
 
 		 849 aa  95.1  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  33.8 
 
 		 385 aa  87.8  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  33.8 
 
 		 385 aa  87.8  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  35.21 
 
 		 388 aa  87  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  23.26 
 
 		 825 aa  87  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  33.1 
 
 		 385 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  27.8 
 
 		 905 aa  81.3  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  27.32 
 
 		 1013 aa  76.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  31.1 
 
 		 923 aa  75.5  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.57 
 
 		 1359 aa  75.5  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  27.78 
 
 		 792 aa  74.3  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  25.77 
 
 		 815 aa  74.3  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  25.85 
 
 		 839 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  26.77 
 
 		 964 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  29.61 
 
 		 380 aa  73.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  31.69 
 
 		 843 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  28.26 
 
 		 806 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  29.06 
 
 		 847 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  19.68 
 
 		 1225 aa  68.2  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  26.07 
 
 		 748 aa  67.8  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  28.86 
 
 		 967 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  27.93 
 
 		 862 aa  67  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  30.41 
 
 		 832 aa  67.4  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  26.82 
 
 		 968 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  27.4 
 
 		 831 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.16 
 
 		 1226 aa  65.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  33.33 
 
 		 782 aa  65.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  25.26 
 
 		 755 aa  64.3  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  28.7 
 
 		 1001 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  28.71 
 
 		 755 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  28.57 
 
 		 747 aa  64.3  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  24.49 
 
 		 780 aa  63.9  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.47 
 
 		 837 aa  64.3  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0221  RND efflux transporter  25.53 
 
 		 771 aa  63.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.822518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>