201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1044 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  50.06 
 
 
864 aa  707    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  51.83 
 
 
864 aa  689    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  100 
 
 
858 aa  1681    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.89 
 
 
882 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.49 
 
 
882 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.79 
 
 
882 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.6 
 
 
882 aa  512  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  37.47 
 
 
895 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  37.99 
 
 
887 aa  488  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  37.09 
 
 
868 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.91 
 
 
882 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  36.09 
 
 
862 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  37.27 
 
 
868 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  36.63 
 
 
862 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  37.22 
 
 
868 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  36.85 
 
 
887 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  35.9 
 
 
872 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  37.72 
 
 
871 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  37.81 
 
 
877 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  37.59 
 
 
871 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  38.42 
 
 
969 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  36.84 
 
 
908 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  36.92 
 
 
870 aa  432  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  38.3 
 
 
1079 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  38.3 
 
 
1083 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  38.49 
 
 
877 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  38.37 
 
 
877 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  38.37 
 
 
877 aa  426  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  38.37 
 
 
877 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  37.92 
 
 
877 aa  422  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  38.84 
 
 
877 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  37.51 
 
 
889 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  37.8 
 
 
877 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.05 
 
 
877 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  37.82 
 
 
877 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  37.69 
 
 
877 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  37.82 
 
 
877 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  40.12 
 
 
669 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  37.49 
 
 
877 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.1 
 
 
900 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  34.05 
 
 
901 aa  389  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  35.09 
 
 
879 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  33.83 
 
 
901 aa  376  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  32.66 
 
 
890 aa  369  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  31.8 
 
 
884 aa  345  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  28.72 
 
 
767 aa  286  8e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  27.4 
 
 
892 aa  264  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  27.26 
 
 
1128 aa  258  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.46 
 
 
886 aa  255  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.92 
 
 
883 aa  241  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  26.63 
 
 
920 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.01 
 
 
883 aa  234  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  26.32 
 
 
910 aa  219  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  27.36 
 
 
899 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  27.56 
 
 
972 aa  207  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  25.92 
 
 
893 aa  195  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  27.24 
 
 
906 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.81 
 
 
1045 aa  137  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  23.42 
 
 
846 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  23.42 
 
 
840 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  24.2 
 
 
840 aa  81.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  24.66 
 
 
849 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  23.56 
 
 
845 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  32.41 
 
 
845 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  25.85 
 
 
1013 aa  64.7  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0221  RND efflux transporter  21.62 
 
 
771 aa  63.5  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.822518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  28.72 
 
 
839 aa  62.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  23.68 
 
 
777 aa  62  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  26.48 
 
 
783 aa  61.6  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  28.65 
 
 
806 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  29.28 
 
 
843 aa  61.2  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  26.86 
 
 
752 aa  60.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.43 
 
 
1109 aa  59.3  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  25.66 
 
 
1003 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0341  hypothetical protein  24.71 
 
 
839 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  25.47 
 
 
794 aa  57.8  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  25.64 
 
 
831 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  33.11 
 
 
879 aa  57.8  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00322  RND superfamily protein  29.44 
 
 
823 aa  57.4  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.33 
 
 
762 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.78 
 
 
1172 aa  57.4  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  30.72 
 
 
1204 aa  56.6  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  27.06 
 
 
747 aa  57  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  25.73 
 
 
840 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  25 
 
 
777 aa  55.5  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0332  hypothetical protein  26.14 
 
 
839 aa  55.8  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  28.95 
 
 
778 aa  55.5  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  32.48 
 
 
1048 aa  55.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  30.3 
 
 
1359 aa  54.7  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  28.83 
 
 
807 aa  54.3  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  27.22 
 
 
792 aa  53.9  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 
1028 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  29.1 
 
 
805 aa  53.5  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  37 
 
 
782 aa  53.5  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  25.96 
 
 
835 aa  53.5  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  26.25 
 
 
800 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  30.57 
 
 
826 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  25.83 
 
 
1011 aa  53.5  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  25.3 
 
 
1000 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  26.09 
 
 
813 aa  53.5  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>