More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0768 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  44.99 
 
 		 752 aa  699    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  100 
 
 		 747 aa  1506    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  45.53 
 
 		 758 aa  705    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  47.83 
 
 		 756 aa  726    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  52.07 
 
 		 746 aa  794    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  50.94 
 
 		 777 aa  769    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  51.45 
 
 		 777 aa  795    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  38.78 
 
 		 752 aa  592  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  36.01 
 
 		 748 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  33.47 
 
 		 812 aa  403  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  32.19 
 
 		 755 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  30.23 
 
 		 778 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  32.97 
 
 		 864 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  25.45 
 
 		 821 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  25.69 
 
 		 865 aa  192  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  25.16 
 
 		 687 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  25.25 
 
 		 889 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.66 
 
 		 764 aa  141  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  28.12 
 
 		 387 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  26.54 
 
 		 385 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  25.51 
 
 		 921 aa  128  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  25 
 
 		 385 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  27.57 
 
 		 380 aa  126  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  24.1 
 
 		 1204 aa  125  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  26.89 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  23.58 
 
 		 1359 aa  122  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  28.18 
 
 		 388 aa  119  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.79 
 
 		 807 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  22.28 
 
 		 831 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.95 
 
 		 1051 aa  105  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.31 
 
 		 778 aa  103  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  23.71 
 
 		 842 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  21 
 
 		 779 aa  92  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  21.07 
 
 		 811 aa  91.3  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  20.1 
 
 		 815 aa  91.3  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  22.75 
 
 		 808 aa  89  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  21.34 
 
 		 787 aa  88.6  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.13 
 
 		 773 aa  87.4  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  33.55 
 
 		 1011 aa  87  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  28.42 
 
 		 923 aa  86.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  29.92 
 
 		 895 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  21.21 
 
 		 821 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.87 
 
 		 807 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  19.87 
 
 		 792 aa  82.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  30.72 
 
 		 874 aa  81.6  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  30.15 
 
 		 893 aa  80.9  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  21.21 
 
 		 800 aa  80.9  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  22.34 
 
 		 835 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  33.96 
 
 		 1131 aa  78.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.86 
 
 		 804 aa  78.2  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  19.71 
 
 		 815 aa  77.4  0.0000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  27.35 
 
 		 910 aa  77.4  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1083 aa  77  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.33 
 
 		 837 aa  77.4  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  20.44 
 
 		 788 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  18.82 
 
 		 764 aa  76.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  19.89 
 
 		 816 aa  75.5  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  27.92 
 
 		 855 aa  75.5  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  21.55 
 
 		 828 aa  75.1  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  25.36 
 
 		 730 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  26.75 
 
 		 862 aa  75.1  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  22.34 
 
 		 974 aa  74.3  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  30 
 
 		 832 aa  74.3  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  24.79 
 
 		 730 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.61 
 
 		 767 aa  73.6  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  20.88 
 
 		 797 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  19.87 
 
 		 803 aa  72.4  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.21 
 
 		 886 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  22.32 
 
 		 974 aa  72.4  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  19.51 
 
 		 755 aa  72.4  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  21.73 
 
 		 981 aa  72  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.46 
 
 		 1045 aa  71.6  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.87 
 
 		 806 aa  71.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  19.17 
 
 		 790 aa  71.2  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.4 
 
 		 1109 aa  69.7  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  24.15 
 
 		 821 aa  68.9  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.9 
 
 		 905 aa  69.3  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  28.57 
 
 		 872 aa  68.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  21.98 
 
 		 795 aa  68.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  19.48 
 
 		 825 aa  68.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  23.35 
 
 		 964 aa  68.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  27.62 
 
 		 972 aa  67.8  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  20.1 
 
 		 788 aa  67.4  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  28.1 
 
 		 862 aa  67.4  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  19.46 
 
 		 797 aa  67.4  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  21.43 
 
 		 800 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  19.08 
 
 		 788 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  23.93 
 
 		 959 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  18.55 
 
 		 796 aa  66.6  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  22.5 
 
 		 730 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  20.57 
 
 		 813 aa  66.6  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  21.05 
 
 		 674 aa  66.2  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  22.5 
 
 		 730 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  22.5 
 
 		 730 aa  66.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  22.5 
 
 		 730 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  22.25 
 
 		 967 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  19.44 
 
 		 816 aa  66.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  26.39 
 
 		 1013 aa  66.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  18.5 
 
 		 785 aa  66.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  22.5 
 
 		 730 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>