271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0113 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 865 aa  1699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  68.97 
 
 		 889 aa  1081    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  58.83 
 
 		 821 aa  923    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  59.51 
 
 		 687 aa  739    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  28.12 
 
 		 748 aa  257  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  28.97 
 
 		 812 aa  255  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  26.72 
 
 		 752 aa  243  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  24.91 
 
 		 777 aa  229  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  23.58 
 
 		 864 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.97 
 
 		 756 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  28.78 
 
 		 778 aa  214  7e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  25.41 
 
 		 755 aa  212  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  28.35 
 
 		 777 aa  211  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  25.83 
 
 		 747 aa  209  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  23.44 
 
 		 758 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.75 
 
 		 746 aa  199  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  25.18 
 
 		 752 aa  167  9e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  25.21 
 
 		 923 aa  118  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  23.19 
 
 		 1359 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.27 
 
 		 764 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  26.09 
 
 		 874 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  30.45 
 
 		 921 aa  111  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  23.43 
 
 		 805 aa  111  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  24.71 
 
 		 895 aa  102  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  24.43 
 
 		 385 aa  100  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  23.65 
 
 		 380 aa  100  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  24.1 
 
 		 385 aa  99  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  96.3  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  25.07 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  24.63 
 
 		 855 aa  76.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  32.26 
 
 		 832 aa  76.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  22.14 
 
 		 784 aa  73.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  25 
 
 		 791 aa  74.3  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.15 
 
 		 755 aa  73.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  21.53 
 
 		 674 aa  72.8  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  22.15 
 
 		 807 aa  73.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  19.44 
 
 		 835 aa  73.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.52 
 
 		 807 aa  72  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  34.81 
 
 		 842 aa  71.2  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  26.51 
 
 		 1011 aa  69.7  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  20.9 
 
 		 1051 aa  69.7  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  29.14 
 
 		 1204 aa  69.3  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  21.33 
 
 		 674 aa  68.9  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  25.08 
 
 		 792 aa  68.9  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  34.24 
 
 		 879 aa  68.6  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.29 
 
 		 778 aa  68.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  23.53 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  30.73 
 
 		 1131 aa  67.8  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  19.1 
 
 		 821 aa  65.9  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.66 
 
 		 898 aa  65.1  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.12 
 
 		 808 aa  65.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  21.68 
 
 		 787 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  28.95 
 
 		 1011 aa  62.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  28.67 
 
 		 972 aa  62  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  19.97 
 
 		 816 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  22.28 
 
 		 794 aa  62  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  28.98 
 
 		 1002 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  26.9 
 
 		 825 aa  62  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  22.31 
 
 		 823 aa  61.6  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  19.42 
 
 		 813 aa  61.6  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  20.7 
 
 		 689 aa  60.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.76 
 
 		 886 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  23.23 
 
 		 788 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  30.47 
 
 		 1001 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  21.91 
 
 		 786 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  32 
 
 		 684 aa  59.3  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  20.95 
 
 		 792 aa  58.9  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  22.22 
 
 		 823 aa  58.9  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  30.41 
 
 		 860 aa  58.9  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  22.22 
 
 		 796 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  26.36 
 
 		 967 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  21.91 
 
 		 786 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  21.91 
 
 		 786 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  28.42 
 
 		 1109 aa  58.5  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  26.52 
 
 		 944 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  21.95 
 
 		 823 aa  58.2  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.29 
 
 		 815 aa  58.2  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  25.45 
 
 		 920 aa  57.8  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  27.65 
 
 		 806 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  29.94 
 
 		 862 aa  57.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  25.54 
 
 		 968 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  20.75 
 
 		 1045 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  19.49 
 
 		 905 aa  56.2  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  26.44 
 
 		 789 aa  56.2  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  34.19 
 
 		 1002 aa  56.2  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  24.24 
 
 		 1013 aa  55.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  23.78 
 
 		 831 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  25.77 
 
 		 893 aa  55.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  20.67 
 
 		 767 aa  55.5  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  32.56 
 
 		 872 aa  55.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  27.78 
 
 		 1003 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  23.09 
 
 		 799 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  32.26 
 
 		 743 aa  55.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  22.55 
 
 		 799 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  22.03 
 
 		 796 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  28.12 
 
 		 709 aa  55.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  26.21 
 
 		 998 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  26.21 
 
 		 998 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  29.27 
 
 		 839 aa  55.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  26.21 
 
 		 998 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>