More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0403 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  50.46 
 
 
1146 aa  976    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  81 
 
 
998 aa  1592    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  47.78 
 
 
1062 aa  889    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  41.03 
 
 
1022 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  41.63 
 
 
1013 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  57.79 
 
 
1002 aa  1139    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  81 
 
 
998 aa  1592    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  47.78 
 
 
1062 aa  889    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  41.03 
 
 
1022 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  81.29 
 
 
1000 aa  1595    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  41.39 
 
 
1028 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  42.76 
 
 
1003 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  51.64 
 
 
1089 aa  1015    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  81 
 
 
998 aa  1592    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0403  transport protein  100 
 
 
1001 aa  1983    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  48.18 
 
 
1077 aa  915    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  41.57 
 
 
1040 aa  656    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  32.64 
 
 
1011 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  33.2 
 
 
1013 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  29.57 
 
 
944 aa  425  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  29.72 
 
 
967 aa  416  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  29.08 
 
 
941 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  29.49 
 
 
948 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  30.22 
 
 
955 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  30.22 
 
 
955 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  30.22 
 
 
955 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  30.56 
 
 
957 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  30.47 
 
 
968 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  30.27 
 
 
968 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  29.31 
 
 
968 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  29.31 
 
 
968 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  29.31 
 
 
968 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  28.88 
 
 
958 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  29.2 
 
 
962 aa  396  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  29.9 
 
 
945 aa  386  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  30.16 
 
 
959 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  29.9 
 
 
945 aa  386  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1614  transport protein  28.46 
 
 
968 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  29.11 
 
 
964 aa  376  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  28.28 
 
 
1001 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11778  MmpL family membrane protein  29.52 
 
 
945 aa  354  5e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000786949  decreased coverage  0.0000000000113435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  41.73 
 
 
681 aa  351  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  28.18 
 
 
968 aa  350  9e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  28.22 
 
 
963 aa  340  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4635  MMPL domain-containing protein  41.53 
 
 
470 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  23.61 
 
 
1109 aa  303  9e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  24.19 
 
 
1109 aa  295  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  25.94 
 
 
1054 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2638  MMPL domain protein  24.83 
 
 
1040 aa  273  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  23.8 
 
 
1049 aa  268  5e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2742  MMPL domain-containing protein  25.17 
 
 
1038 aa  266  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  24.22 
 
 
1038 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2670  hypothetical protein  24.26 
 
 
1041 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2990  MmpL family membrane protein putative  24.48 
 
 
1038 aa  251  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.189958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2691  MmpL family membrane protein  24.29 
 
 
1041 aa  250  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.475251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2996  putative membrane protein, MmpL family  23.95 
 
 
1038 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000662064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0343  MMPL domain protein  26.48 
 
 
1068 aa  244  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2287  membrane protein, MmpL family  23.83 
 
 
1038 aa  241  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0482318  hitchhiker  0.0000000000000416433 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  26.2 
 
 
888 aa  220  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11589  transmembrane transport protein mmpL6  38.54 
 
 
397 aa  191  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9101799999999998e-86  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0890  MMPL domain protein  20.51 
 
 
1026 aa  177  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000250771  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  39.02 
 
 
974 aa  164  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  26.52 
 
 
981 aa  163  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  25.13 
 
 
974 aa  163  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2741  hypothetical protein  24.07 
 
 
810 aa  157  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  41.13 
 
 
753 aa  152  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  38.78 
 
 
743 aa  151  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  38.78 
 
 
743 aa  151  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  38.78 
 
 
743 aa  151  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  38.78 
 
 
743 aa  151  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  36.33 
 
 
743 aa  151  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  45.79 
 
 
750 aa  151  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  38.37 
 
 
743 aa  151  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  41.36 
 
 
764 aa  149  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  38 
 
 
743 aa  148  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  37.96 
 
 
743 aa  148  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  38 
 
 
743 aa  146  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  42 
 
 
737 aa  144  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  38.78 
 
 
743 aa  142  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  39.58 
 
 
712 aa  142  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1630  hypothetical protein  24.91 
 
 
1246 aa  141  7e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0499126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  42.73 
 
 
576 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  31.97 
 
 
713 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  38.04 
 
 
674 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  42.79 
 
 
780 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  38.04 
 
 
674 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  38.18 
 
 
674 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  33.6 
 
 
882 aa  134  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  30.25 
 
 
730 aa  134  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  31.07 
 
 
745 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  36.81 
 
 
673 aa  132  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  40.09 
 
 
709 aa  132  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  39.39 
 
 
697 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  39.34 
 
 
713 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  35.97 
 
 
699 aa  126  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  34.91 
 
 
702 aa  125  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  32.94 
 
 
740 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  42.86 
 
 
699 aa  124  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  28.64 
 
 
723 aa  125  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  35.71 
 
 
679 aa  125  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.316421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>